uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden
Cat.Nr.S8068
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK Histone Acetyltransferase |
|---|---|
| Overige Histone Methyltransferase Inhibitoren | Pinometostat (EPZ5676) 3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride BIX-01294 trihydrochloride UNC1999 EPZ015666 (GSK3235025) EPZ004777 MM-102 (HMTase Inhibitor IX) SGC 0946 EPZ005687 UNC0638 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A549 | Cytotoxicity assay | Cytotoxicity against human A549 cells, IC50 = 0.025 μM. | 20303767 | |||
| Hep3b | Function assay | Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF expression in human Hep3b cells by luciferase reporter gene assay, IC50 = 0.04 μM. | 22305612 | |||
| Hep3b | Function assay | Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF secretion in human Hep3b cells by ELISA, IC50 = 0.1 μM. | 22305612 | |||
| Jurkat | Cytotoxicity assay | 40 hrs | Cytotoxicity against human Jurkat cells after 40 hrs bioluminescence assay, IC50 = 0.6 μM. | 20303767 | ||
| Drosophila melanogaster SL2 | Function assay | 0.1 uM | 5 days | Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.1 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density | 16408017 | |
| Drosophila melanogaster SL2 | Function assay | 0.5 uM | 5 days | Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.5 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density | 16408017 | |
| Drosophila melanogaster SL2 | Function assay | 0.5 uM | Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me3 at 0.5 uM by immunostaining method | 16408017 | ||
| HL60 | Apoptosis assay | 30 uM | 4 hrs | Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as necrotic cell death at 30 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis | 20675131 | |
| HL60 | Apoptosis assay | 0.3 uM | 4 hrs | Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as nuclear fragmentation at 0.3 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis | 20675131 | |
| HL60 | Apoptosis assay | 0.3 uM | 2 hrs | Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as activation of caspase 3 at 0.3 uM after 2 hrs by Western blot analysis | 20675131 | |
| MCF7 | Function assay | Inhibition of histone-lysine N-methyltransferase in human MCF7 cells assessed as decrease in methylation of RARbeta DNA by qPCR method | ChEMBL | |||
| Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken | ||||||
| Moleculair gewicht | 696.84 | Formule | C30H28N6O6S4 |
Opslag (Vanaf de ontvangstdatum) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 28097-03-2 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
|
In vitro |
DMSO
: 25 mg/mL
(35.87 mM)
Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
dSU(VAR)3-9
0.8 μM
mouse G9a
2.5 μM
Neurospora crassa DIM5
3 μM
|
|---|---|
| In vitro |
In SL-2 Drosophila weefselkweekcellen veroorzaakt Chaetocin de remming van SU(VAR)3-9 en het aantal H3-moleculen die gedi-methylated zijn op Lys9, en remt het ook de celgroei. In HepG2, Hep3B en Huh7 menselijke hepatomacellen remt deze verbinding HIF-1-gemedieerde hypoxische responsen. Het remt ook krachtig de proliferatie en kolonieformatie in een breed scala aan kankercellijnen met een IC50 van 2-10 nM. |
| Kinase Assay |
Methylatietesten
|
|
Tenzij anders vermeld, worden reacties als volgt uitgevoerd: 1 g gezuiverd enzym (dSU(VAR)3-9 213; GST-hSUV39H1(82-412); GST-ncDIM5(19-318) en GSTmG9a(621-1000); dPRSET7(1-691); His-SET7/9(109-366) of enzymcomplex uitgedrukt in een baculoviraal expressiesysteem (dE(z), dSU(Z)12, dp55, dESC) werden gedurende 30 minuten geïncubeerd met 1 g van een peptide dat de eerste 19 aminozuren van H3 plus een extra cysteïneresidu (ARTKQTARKSTGGKAPRKQC) bevatte in een totaal volume van 40μl in BC25 (10mM HEPES pH7.6, 25mM NaCl, 1mM EDTA, 10% glycerol). Alle enzymen, behalve het E(z)-complex, hadden een vergelijkbare specifieke activiteit tussen 5-10 nmol/min/mg. Voor het E(z)-complex is de specifieke activiteit ongeveer 5-10 keer lager, wat waarschijnlijk te wijten is aan een onvolledige vorming van het volledige complex dat nodig is voor de hoogste activiteit. Als methyldonor is S-Adenosyl [methyl-3H] methionine (SAM) aanwezig in de reactie in een uiteindelijke concentratie van 40 M met een specifieke activiteit van 0,3 Ci/mmol. Reacties worden gestopt door 1/10 volume 100% azijnzuur toe te voegen en de incorporatie van radioactiviteit wordt gemeten door 30 μl van de reactie op P81-filterpapier te spotten en vervolgens te scintillatietellen. Voor de inhibitortest wordt 1 μl van deze verbinding met een concentratie van 10 g/l aan elke reactie toegevoegd. In de gevallen waarin PRSET7 of het E(z)-complex als enzym wordt gebruikt, werden respectievelijk recombinante nucleosomen (1 g) of recombinant H3 (1 g) vervangen als substraat voor het H3-peptide.
|
|
| In vivo |
Bij Hepa 1c1c-7 tumor-dragende muizen remt Chaetocin (0,25 mg/kg, i.p.) tumorgroei door deregulatie van HIF-1[alpha]-gemedieerde angiogenese. Bij SKOV3 tumor-dragende naaktmuizen vertraagt deze behandeling met de verbinding (0,25 mg/kg, i.p.) de tumorgroei aanzienlijk met minimale tekenen van toxiciteit. |
Referenties |
|
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | Procaspase-3 / Cleaved Caspase-3 / PARP |
|
26890137 |
| Growth inhibition assay | Cell viability |
|
18176557 |
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, kunt u een bericht achterlaten.