nur für Forschungszwecke

Decitabine DNA Methyltransferase Inhibitor

Kat.-Nr.S1200

Decitabine ist ein DNA methyltransferase inhibitor, der in die DNA eingebaut wird und zu einer Hypomethylierung der DNA sowie einem Arrest der DNA-Replikation in der S-Phase führt. Es wird zur Behandlung des myelodysplastischen Syndroms (MDS) eingesetzt. Decitabine induziert Zellzyklusarrest und Apoptose in verschiedenen Krebszelllinien.
Decitabine DNA Methyltransferase Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 228.21

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Qualitätskontrolle (Quality Control)

Charge: Reinheit: 99.90%
99.90

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
Eca109 Function Assay 0.5 μM 24 h water modulates the gene expression of MAGE-A members 25123082
Eca109 Growth Inhibition Assay 0.5/2.5/5 μM 24/48/72 h water inhibits cell growth in both dose- and time- dependent manner 25123082
Eca109 Function Assay 0.5 μM 6/12/24 h water inhibits cell migration  25123082
Eca109 Function Assay 0.5 μM 24 h water inhibits cell invasion 25123082
Eca109 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 24 h water induces G2/M arrest in the cell cycle 25123082
Eca109 Function Assay 0.5/1 μM 24 h water decreases expression of NF-κB2 and MMP2 25123082
SW1116  Growth Inhibition Assay 0.5/1/2/5 μM 48 h DMSO enhances the Gefitinib induced cell inhibition 24874286
LOVO Growth Inhibition Assay 0.5/1/2/5 μM 48 h DMSO enhances the Gefitinib induced cell inhibition 24874286
SW1116  Function Assay 10 μM 48 h DMSO increases the effective at inhibiting AKT and mTOR signaling pathways combined with gefitinib 24874286
LOVO Function Assay 10 μM 48 h DMSO increases the effective at inhibiting AKT and mTOR signaling pathways combined with gefitinib 24874286
SW1116  Apoptosis Assay 10 μM 48 h DMSO enhances Gefitinib-induced apoptosis 24874286
LOVO Apoptosis Assay 10 μM 48 h DMSO enhances Gefitinib-induced apoptosis 24874286
RPMI-8226 Apoptosis Assay 1/2 μM 48/72/96 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
OPM-2  Apoptosis Assay 1/2 μM 72/96/120 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
JJN3  Apoptosis Assay 0.5/1 μM 24/48 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
NCI-H929  Apoptosis Assay 1/2 μM 72/96/120 h DMSO induces cell apoptosis 24833108
RPMI-8226 Growth Inhibition Assay 1/2 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
OPM-2  Growth Inhibition Assay 1/2 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
JJN3  Growth Inhibition Assay 0.5/1 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
NCI-H929  Growth Inhibition Assay 1/2 μM 24/48/72 h DMSO affects cell cycle progression negatively 24833108
HeLa Kinase Assay Ki=1000–5000 μM for hENT1 24780098
HeLa Kinase Assay Ki=5.6 ± 0.5 μM for hENT2 24780098
HeLa Kinase Assay Ki=21.6 ± 3.0 μM for hCNT1 24780098
HeLa Kinase Assay Ki=14.4 ± 4.6 μM for hCNT3 24780098
NB4 Function Assay 2.5/5/7.5/10 μM 24 h DMSO increasea the expression of precursor miR-125a 24484870
CD4+ CD25− T  Function Assay 1/5 μM reduceS global DNA methylation 24476360
BV-173 Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
ML-1 Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
HL-60 Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
KG-1a Apoptosis Assay 0.25/0.5/0.75/1 μM 48/72/96 h  PBS induces cell apoptosis in both dose- and time- dependent manner 24423613
BV-173 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
CEM Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
HL-60 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
ML-1 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS induces delayed and sustained ROS increase 24423613
DLD-1 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS do not induces delayed and sustained ROS increase 24423613
HCT-116 Function Assay 250/500nM 48 h  PBS do not induces delayed and sustained ROS increase 24423613
U937-A/E-9/14/18  Apoptosis Assay 0.01/0.1/1/10 μM 48 h induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24300456
HT29 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1400±179 μM 24172061
SW48 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=15.2±6.2 μM 24172061
HCT116 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1.7±0.4 μM 24172061
HepG2 Function Assay 0.5/1 μM 24 h DMSO up-regulated the relative OCTN2 mRNA and protein expression 24146874
LS174T Function Assay 0.5/1 μM 24 h DMSO lead to an increase of OCTN2 levels 24146874
HepG2 Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
LS174T Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
QBC-939 Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
U251 Apoptosis Assay 1/10/100 μM 7 d DMSO induces cell apoptosis in a dose-dependent manner 24146874
HL-60 Growth Inhibition Assay 1 μM 48 h increases G2-phase cell fraction 24000324
MDA‑MB‑453 Function Assay 0.2/1 μM 72 h causes re-expression of claudin 1  23844228
HCC1569 Function Assay 0.2/1 μM 72 h causes re-expression of claudin 1  23844228
BT‑474 Function Assay 0.2/1 μM 72 h causes re-expression of claudin 1  23844228
AGS Apoptosis Assay 5/10/20/50 μM 48 h  DMSO inhibits the cell viability  23582784
A549 Apoptosis Assay 5/10/20/50 μM 48 h  DMSO inhibits the cell viability  23582784
AGS  Growth Inhibition Assay 5/10/20/50 μM 48 h  DMSO induces G2/M phase arrest  23582784
Kasumi-1 Apoptosis Assay 0.5 μM 48 h  decreases the cell viability co-treated with Tf-NP-sc 23493348
OCI-AML3 Apoptosis Assay 2.5 μM 48 h  decreases the cell viability co-treated with Tf-NP-sc 23493348
MV4-11 Apoptosis Assay 2.5 μM 48 h  decreases the cell viability co-treated with Tf-NP-sc 23493348
NK  Cytotoxity Assay 0.02-20 μM 5 d decreases the cytolytic activity of NK cells at intermediate concentrations resulting in a U-shaped dose–response curve 23328088
NK  Apoptosis Assay 0.02-20 μM 5 d decrease NK cell proliferation and viability as the concentration increased 23328088
NK  Function Assay 0.01-20 μM 5 d causes hypomethylation of NK cells in a dose–response 23328088
MOLT4/DNR Function Assay 5 μM 4 d reduces ABCB1 mRNA expression 23060570
Jurkat/DOX Function Assay 5 μM 4 d reduces ABCB1 mRNA expression 23060570
MOLT4/DNR Growth Inhibition Assay 5 μM 4 d reduces the IC50 value for daunorubicin sensitivity 23060570
Jurkat/DOX Growth Inhibition Assay 5 μM 4 d reduces the IC50 value for daunorubicin sensitivity 23060570
ccRCC  Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO has minimal effect on cell proliferation 22826467
TNBC  Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO has minimal effect on cell proliferation 22826467
A498 Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
KIJ265T Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
MDA-231 Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
BT-20 Apoptosis Assay 0.01-10μM 72 h DMSO induces synergistic responses with romidepsin 22826467
U937 Growth Inhibition Assay 5-20 μM 24/48/72 h induces a decrease in cell viability in a concentration- and time-dependent manner 22767021
HL60 Growth Inhibition Assay 5-20 μM 24/48/72 h induces a decrease in cell viability in a concentration- and time-dependent manner 22767021
U937 Apoptosis Assay 15 μM 24/48/72 h induces cell apoptosis 22767021
HL60 Apoptosis Assay 15 μM 24/48/72 h induces cell apoptosis 22767021
LS411N  Apoptosis Assay 0.5 μM 72 h increases Fas mRNA level 22461695
MDA-MB-231 Apoptosis Assay 10 μM 48 h reduces cell viability in a dose-dependent manner 21887697
MCF-7  Apoptosis Assay 10 μM 48 h reduces cell viability in a dose-dependent manner 21887697
A375 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
SKMEL1 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
SKMEL3 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
SKMEL28 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
MeWo Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
B16 Growth Inhibition Assay 0.5 μM 1/5/8 d inhibits proliferation and induces differentiation of melanoma cells 21796622
Ly 1 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=7.3 μM 21772049
Ly 7 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=10.7 μM 21772049
Su-DHL6 Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
Ly 10 Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
RIVA Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
Su-DHL2 Growth Inhibition Assay 24 h IC50>20 μM 21772049
Ly 1 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=0.34 μM 21772049
Ly 7 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=0.025 μM 21772049
Su-DHL6 Growth Inhibition Assay 48 h IC50>20 μM 21772049
Ly 10 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=1.8 μM 21772049
RIVA Growth Inhibition Assay 48 h IC50>20 μM 21772049
Su-DHL2 Growth Inhibition Assay 48 h IC50=17.4 μM 21772049
Ly 1 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=0.01 μM 21772049
Ly 7 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=0.018 μM 21772049
Su-DHL6 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1.6 μM 21772049
Ly 10 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=1.2 μM 21772049
RIVA Growth Inhibition Assay 72 h IC50>20 μM 21772049
Su-DHL2 Growth Inhibition Assay 72 h IC50=11.2 μM 21772049
U373-MAGI Antiviral assay 0.25 to 8 uM 2 to 72 hrs Antiviral activity against VSV-G pseudotyped HIV-1 NL4-3 infected in human U373-MAGI cells assessed as reduction in U5-gag level at 0.25 to 8 uM after 2 to 72 hrs by qPCR method 27117260
U373-MAGI Antiviral assay 0.25 to 8 uM 2 to 72 hrs Antiviral activity against VSV-G pseudotyped HIV-1 NL4-3 infected in human U373-MAGI cells assessed as reduction in gag level at 0.25 to 8 uM after 2 to 72 hrs by qPCR method 27117260
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekulargewicht 228.21 Formel

C8H12N4O4

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 2353-33-5 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme Deoxycytidine, 5-aza-2'-deoxycytidine, 5-AZA-dC, 5-aza-CdR,NSC 127716 Smiles C1C(C(OC1N2C=NC(=NC2=O)N)CO)O

Löslichkeit (Solubility)

In vitro
Charge:

DMSO : 45 mg/mL (197.18 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : 22.5 mg/mL

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
DNA methylation
(HL-60, KG1a cells)
In vitro

Decitabine hemmt das Zellwachstum dosis- und zeitabhängig mit einem IC50 von ungefähr 438 nM und 43,8 nM bei einer Exposition von 72 Stunden bzw. 96 Stunden in HL-60- und KG1a-Leukämiezellen. Eine aktuelle Studie zeigt, dass diese Verbindung eine hohe antiproliferative und pro-apoptotische Aktivität gegen anaplastisches großzelliges Lymphom (ALCL) aufweist und die [3H]–Thymidin-Aufnahme in KARPAS-299-Zellen mit einem EC50 von 0,49 μM hemmt.

Kinase-Assay
DNA synthesis assay
Die Rate der DNA-Synthese wird durch den Einbau von radioaktivem Thymidin in die DNA gemessen. HL-60- und KG1a-Zellen werden in 2 ml RPMI-Medium, das 10% fetales Serum enthält, in 6-Well-Schalen (35 mm Durchmesser) suspendiert und 48 Stunden lang mit verschiedenen Konzentrationen der entsprechenden Medikamente inkubiert (Medikamente werden gleichzeitig hinzugefügt). Nach 48 Stunden werden 0,5 μCi [3H]-Thymidin (6,7 Ci/mmol) zu jedem Well hinzugefügt und weitere 24 Stunden inkubiert. Die Zellen werden auf GF/C-Glasfaserfiltern (2,4 cm Durchmesser) platziert, mit kaltem 0,9% NaCl, 5% kalter Trichloressigsäure und Ethanol gewaschen. Die DNA enthaltenden Filter werden dann getrocknet, in EcoLite-Szintillationsflüssigkeit (ICN) gegeben und die Radioaktivität mit einem Beckman LS 6000IC-Szintillationszähler gemessen. Der IC50 ist definiert als die Medikamentenkonzentration, die 50% der DNA-Synthese der Leukämiezelllinien aus der Dosis-Wirkungs-Kurve hemmt.
In vivo

In einem ALK+ KARPAS-299 Maus-Xenograft-Modell bewirkt Decitabine in einer Dosis von 2,5 mg/kg eine erhöhte Apoptose und eine reduzierte Proliferation der Tumorzellen, und führt auch zur Demethylierung des Tumorsuppressorgens p16INK4A.

Literatur

Anwendungen (Applications)

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot Survivin / Bcl-2 / p53 / c-Myc / DNMT1 p-AKT / AKT / p-GSK3β / GSK3β / p-Myc / Myc / p-P70 / P70 / p-4EBP-1 / 4EBP-1 / PTEN phospho-p38 / p38 / phospho-NFκB / NFκB p-JAK1 / JAK1 / p-JAK2 / JAK2 / p-STAT3 / STAT3 E-cadherin / N-cadherin / Snail / MMP-2 / MMP-9 / Bcl-2 / Bax
S1200-WB1
26384351
Immunofluorescence DNMT1 E-cadherin / MMP-9
S1200-IF1
21303982
Growth inhibition assay Cell viability
S1200-viability1
26384351

Klinische Studieninformationen (Clinical Trial Information)

(Daten von https://clinicaltrials.gov, aktualisiert am 2024-05-22)

NCT-Nummer Rekrutierung Erkrankungen Sponsor/Kooperationspartner Startdatum Phasen
NCT06291285 Not yet recruiting
Healthy Volunteers
Novo Nordisk A/S
February 27 2024 Phase 1
NCT05960773 Recruiting
Mesothelioma|Malignant Mesothelioma (MM)|Early-stage Mesothelioma|Subclinical Mesothelioma|BRCA1-Associated Protein-1 (BAP1) Mutations|Early-stage BAP1-associated Malignancies
National Cancer Institute (NCI)|National Institutes of Health Clinical Center (CC)
January 31 2024 Phase 2
NCT05835011 Terminated
Myelodysplastic Syndromes
Astex Pharmaceuticals Inc.
July 14 2023 Phase 2
NCT05816356 Recruiting
Healthy
EpiDestiny Inc.|Worldwide Clinical Trials
March 24 2023 Phase 1

Häufig gestellte Fragen (Frequently Asked Questions)

Frage 1:
Is it a racemic mixture or a monomer?

Antwort:
Its S1200 is R form.