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Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK Inhibitor

Kat.-Nr.S1574

Doramapimod (BIRB 796) ist ein Pan-p38 MAPK-Inhibitor mit einem IC50 von 38 nM, 65 nM, 200 nM und 520 nM für p38α/β/γ/δ in zellfreien Assays. Es bindet p38α mit einem Kd von 0,1 nM in THP-1-Zellen, zeigt eine 330-fach höhere Selektivität gegenüber JNK2, eine schwache Hemmung von c-RAF, Fyn und Lck und eine insignifikante Hemmung von ERK-1, SYK, IKK2.
Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 527.66

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Qualitätskontrolle (Quality Control)

Charge: Reinheit: 99.99%
99.99

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
HOP-92 Growth Inhibition Assay IC50=24.3838 μM SANGER
NCI-H2228 Growth Inhibition Assay IC50=23.6668 μM SANGER
CAPAN-1 Growth Inhibition Assay IC50=22.1884 μM SANGER
SK-MEL-1 Growth Inhibition Assay IC50=20.3683 μM SANGER
DB Growth Inhibition Assay IC50=18.7923 μM SANGER
AN3-CA Growth Inhibition Assay IC50=18.1 μM SANGER
EW-13 Growth Inhibition Assay IC50=17.9516 μM SANGER
LC-2-ad Growth Inhibition Assay IC50=17.4366 μM SANGER
ES8 Growth Inhibition Assay IC50=17.167 μM SANGER
NCI-H1581 Growth Inhibition Assay IC50=17.0447 μM SANGER
HMV-II Growth Inhibition Assay IC50=14.2309 μM SANGER
BEN Growth Inhibition Assay IC50=13.1264 μM SANGER
NBsusSR Growth Inhibition Assay IC50=10.8235 μM SANGER
MS-1 Growth Inhibition Assay IC50=10.8235 μM SANGER
BFTC-905 Growth Inhibition Assay IC50=10.1233 μM SANGER
NCI-SNU-1 Growth Inhibition Assay IC50=9.06739 μM SANGER
MPP-89 Growth Inhibition Assay IC50=8.46251 μM SANGER
T-24 Growth Inhibition Assay IC50=8.40673 μM SANGER
KP-N-YN Growth Inhibition Assay IC50=8.2019 μM SANGER
IST-MES1 Growth Inhibition Assay IC50=7.95637 μM SANGER
NCI-H358 Growth Inhibition Assay IC50=7.538 μM SANGER
GOTO Growth Inhibition Assay IC50=6.39161 μM SANGER
DU-145 Growth Inhibition Assay IC50=3.93811 μM SANGER
EoL-1-cell Growth Inhibition Assay IC50=0.34763 μM SANGER
KYSE-270 Growth Inhibition Assay IC50=24.5573 μM SANGER
HCC1806 Growth Inhibition Assay IC50=24.7799 μM SANGER
HuO-3N1 Growth Inhibition Assay IC50=25.8185 μM SANGER
HOS Growth Inhibition Assay IC50=25.9292 μM SANGER
KYSE-510 Growth Inhibition Assay IC50=26.1612 μM SANGER
COLO-741 Growth Inhibition Assay IC50=26.3329 μM SANGER
H-EMC-SS Growth Inhibition Assay IC50=26.9245 μM SANGER
HCC1937 Growth Inhibition Assay IC50=27.2238 μM SANGER
NCI-H2126 Growth Inhibition Assay IC50=27.3975 μM SANGER
NCI-H1703 Growth Inhibition Assay IC50=28.0413 μM SANGER
U-2-OS Growth Inhibition Assay IC50=28.5515 μM SANGER
DBTRG-05MG Growth Inhibition Assay IC50=28.5651 μM SANGER
MHH-ES-1 Growth Inhibition Assay IC50=31.941 μM SANGER
HCC1419 Growth Inhibition Assay IC50=32.1119 μM SANGER
HOP-62 Growth Inhibition Assay IC50=32.2701 μM SANGER
AM-38 Growth Inhibition Assay IC50=32.9931 μM SANGER
NCI-H2009 Growth Inhibition Assay IC50=33.4007 μM SANGER
EM-2 Growth Inhibition Assay IC50=33.5511 μM SANGER
SW1116 Growth Inhibition Assay IC50=34.4838 μM SANGER
SK-N-AS Growth Inhibition Assay IC50=35.0714 μM SANGER
ChaGo-K-1 Growth Inhibition Assay IC50=35.6032 μM SANGER
RT-112 Growth Inhibition Assay IC50=35.9879 μM SANGER
HTC-C3 Growth Inhibition Assay IC50=36.2355 μM SANGER
SK-NEP-1 Growth Inhibition Assay IC50=36.6106 μM SANGER
LB831-BLC Growth Inhibition Assay IC50=37.6541 μM SANGER
CTB-1 Growth Inhibition Assay IC50=38.4512 μM SANGER
MOLT-4 Growth Inhibition Assay IC50=38.8391 μM SANGER
SW756 Growth Inhibition Assay IC50=40.9385 μM SANGER
CAL-72 Growth Inhibition Assay IC50=42.03 μM SANGER
KNS-62 Growth Inhibition Assay IC50=42.6296 μM SANGER
KARPAS-299 Growth Inhibition Assay IC50=43.3233 μM SANGER
HEL Growth Inhibition Assay IC50=45.4646 μM SANGER
KP-4 Growth Inhibition Assay IC50=46.7361 μM SANGER
NEC8 Growth Inhibition Assay IC50=47.1661 μM SANGER
G-402 Growth Inhibition Assay IC50=48.7012 μM SANGER
Sf21 Function assay Binding affinity to wild type human biotin labelled p38 alpha (9 to 352 residues) expressed in sf21 insect cells SPR analysis, Kd = 0.000123 μM. 28834431
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.013 μM. 18325768
U937 Antiinflammatory assay 2 hrs Antiinflammatory activity in differentiated human U937 cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production preincubated for 2 hrs followed by LPS-stimulation for 4 hrs by sandwich ELISA relative to vehicle-treated control, IC50 = 0.015 μM. 26800309
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 19356929
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) production in THP-1 cells, EC50 = 0.018 μM. 12086485
THP Function assay Tested for inhibition of Tumor necrosis factor, alpha in THP cells, EC50 = 0.018 μM. 14561087
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 17560108
THP1 Function assay Inhibition of LPS-stimulated TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 18462940
HLF Function assay Inhibition of p38alpha phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.047 μM. 18602262
HLF Function assay Inhibition of HSP27 phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.058 μM. 18602262
HEK293F Function assay Inhibition of sodium arsenate activated N-terminal GST-tagged Brugia malayi MPK1 expressed in HEK293F cells using FAM-p38tide as substrate by IMAP assay, IC50 = 0.14 μM. 29541362
BL21(DE3) Function assay Inhibition of p38alpha active form expressed in Escherichia coli BL21(DE3) cells by HTRF assay, IC50 = 0.25 μM. 19928858
whole blood cells Antiinflammatory assay 4 hrs Antiinflammatory activity in human whole blood cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production after 4 hrs by time-resolved fluorescence assay, IC50 = 0.6 μM. 22749282
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekulargewicht 527.66 Formel

C31H37N5O3

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 285983-48-4 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme N/A Smiles CC1=CC=C(C=C1)N2C(=CC(=N2)C(C)(C)C)NC(=O)NC3=CC=C(C4=CC=CC=C43)OCCN5CCOCC5

Löslichkeit (Solubility)

In vitro
Charge:

DMSO : 100 mg/mL (189.51 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Ethanol : 100 mg/mL

Water : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus (Mechanism of Action)

Merkmale
The first p38 MAPK inhibitor to be tested in a phase III clinical trial.
Targets/IC50/Ki
JNK2
c-RAF
Fyn
p38α
(Cell-free assay)
0.1 nM(Kd)
p38α
38 nM
In vitro

Doramapimod (BIRB 796) zeigt keine signifikante Hemmung von ERK-1, SYK, IKK2β, ZAP-70, EGF-Rezeptor-Kinase, HER2, Proteinkinase A (PKA), PKC, PKC-α, PKC-β (I und II) und PKC-γ. Diese Verbindung verbessert die Bindungsaffinität erheblich durch die Bildung einer Wasserstoffbrücke zwischen dem Morpholin-Sauerstoff und der ATP-Bindungsdomäne von p38α. Es stellt einen der potentesten und am langsamsten dissoziierenden Inhibitoren gegen die menschliche p38 MAP-Kinase dar, die derzeit bekannt sind.

Es hemmt potent c-Raf-1 und Jnk2α2 mit IC50-Werten von 1,4 bzw. 0,1 nM.

BIRB796 hemmt auch die Aktivität und Aktivierung von SAPK3/p38γ bei einer höheren Konzentration als bei p38α. Es blockiert die stressinduzierte Phosphorylierung des Gerüstproteins SAP97, einem physiologischen Substrat von SAPK3/p38γ. Diese Verbindung blockiert die JNK1/2-Aktivierung und -Aktivität in HEK293-Zellen, hemmt jedoch nicht die Aktivierung und Aktivität von ERK1/ERK2 in Hela-Zellen. Darüber hinaus beeinträchtigt die Bindung von BIRB796 an die p38 MAPKs oder JNK1/2 deren Phosphorylierung durch die stromaufwärtigen Kinasen MKK6 oder MKK4, anstatt deren Dephosphorylierung zu verbessern.

Es blockiert die Basal- und Hochregulierung der p38 MAPK- und Hsp27-Phosphorylierung, wodurch die Zytotoxizität und Caspase-Aktivierung verstärkt werden. Diese Verbindung reguliert die IL-6- und VEGF-Sekretion in BMSCs, ausgelöst durch TNF-α und TGF-β1, herunter.

Es besitzt ein Pyrazolgerüst, das eine lipophile t-Butylgruppe in die untere Selektivitätsstelle und einen Tolylring in die obere Selektivitätsstelle platziert. Diese Verbindung hemmt auch B-Raf und Abl mit IC50-Werten von 83 nM bzw. 14,6 μM.

Kinase-Assay
Verfahren für den zellulären THP-1-Assay zur Hemmung der LPS-stimulierten TNF-α-Produktion
THP-1-Zellen werden in Gegenwart und Abwesenheit von Doramapimod (BIRB 796) 30 Minuten lang vorinkubiert. Die Zellmischung wird mit LPS (1 μg/mL Endkonzentration) stimuliert und die Inkubation über Nacht (18–24 Stunden) wie oben beschrieben fortgesetzt. Der Überstand wird mittels eines kommerziell erhältlichen ELISA auf menschliches TNF-α analysiert. Die Daten werden kombiniert und mittels nichtlinearer Regression unter Verwendung eines dreiparametrigen logistischen Modells analysiert, um einen EC50-Wert zu erhalten. Diese Verbindung wird in jedem Experiment analysiert, und die 95%-Konfidenzintervalle für den EC50 liegen zwischen 16 und 22 nM.
In vivo

Doramapimod (BIRB 796) (30 mg/kg) hemmt 84% des TNF-α in LPS-stimulierten Mäusen und zeigt Wirksamkeit in einem Mausmodell der etablierten kollageninduzierten Arthritis.

Diese Verbindung weist auch nach oraler Verabreichung bei Mäusen eine gute pharmakokinetische Leistung auf.

Literatur
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17173546/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20621496/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561087/

Anwendungen (Applications)

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot p-p38 / γ-H2AX mTOR / p-S6K / S6K / p-MK2 / MK2 / p-Hsp27 / Hsp27 p-p38 / p38
S1574-WB3
27082306

Klinische Studieninformationen (Clinical Trial Information)

(Daten von https://clinicaltrials.gov, aktualisiert am 2024-05-22)

NCT-Nummer Rekrutierung Erkrankungen Sponsor/Kooperationspartner Startdatum Phasen
NCT02211885 Completed
Healthy
Boehringer Ingelheim
October 2002 Phase 1