Neomycin sulfate

Neomycin interagiert bevorzugt mit dem Ribozym-Substrat-Komplex, und diese Interaktion führt zu einer Reduzierung der Spaltungsrate, indem sie den Grundzustand des Komplexes stabilisiert und den Übergangszustand des Spaltungsschritts destabilisiert. [1] Neomycin bewirkt eine Konformationsänderung in der Struktur der transaktivierenden Region (TAR), die durch Zirkulardichroismus-Spektroskopie nachgewiesen werden kann. Neomycin wirkt als nicht-kompetitiver Inhibitor, der an den Tat-TAR-Komplex binden und die Geschwindigkeitskonstante (koff) für die Dissoziation des Peptids von der RNA erhöhen kann. [2] Neomycin ist das wirksamste Aminoglykosid (Grabenbinder) bei der Stabilisierung einer DNA-Dreifachhelix. Neomycin stabilisiert TAT sowie gemischte Basen-DNA-Triplexe besser als bekannte DNA-Minor-Groove-Binder (die üblicherweise den Triplex destabilisieren) und Polyamine. Neomycin zeigt eine Präferenz für die Stabilisierung von TAT-Tripletts, kann aber auch CGC(+)-Tripletts aufnehmen. [3] Neomycin induziert eine konzentrations- und spannungsabhängige teilweise Blockade sowohl von der zytosolischen als auch von der luminalen Seite des Kanals. Neomycin hat eine höhere Affinität für die luminale Interaktionsstelle als für die zytosolische Stelle: Die Dissoziationskonstanten bei Nullspannung (Kb(0)) betragen für die luminale bzw. zytosolische Blockade 210,20 nM bzw. 589,70 nM. Neomycin zeigt auch eine spannungsabhängige Aufhebung der Blockade bei Haltepotentialen >+60 mV. [4]