ATG4B Antibody [P14M3]

Katalog-Nr. F4916

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Biologische Beschreibung

Spezifität ATG4B Antibody [P14M3] detektiert endogene Spiegel des gesamten ATG4B-Proteins.
Hintergrund ATG4B ist eine entscheidende Cysteinprotease bei der Autophagie, die für die Verarbeitung und das Recycling von Proteinen der ATG8-Familie wie LC3 und GABARAP verantwortlich ist, wodurch die Autophagosom-Biogenese bei Eukaryoten ermöglicht wird. ATG4B enthält eine katalytische Triade, bestehend aus Cys74, Asp278 und His280 innerhalb einer Papain-ähnlichen Faltung, mit einer regulatorischen Schleife und Trp142, die das Enzym in einem autoinhibierten Zustand halten, bis die Substratbindung konformative Änderungen für die Peptidbindungs-Hydrolyse induziert. N-terminale Motive erhöhen zusätzlich die Spezifität für LC3, das an Phosphatidylethanolamin (PE) auf autophagischen Membranen konjugiert ist. Die primäre Funktion von ATG4B besteht darin, das C-terminale Glycin auf Pro-LC3 durch eine anfängliche Primärspaltung freizulegen, es für die Konjugation an PE über die ATG7/ATG3-Ubiquitin-ähnliche Kaskade vorzubereiten und anschließend die Delipidierung von LC3-PE auf der äußeren autophagosomalen Membran zu katalysieren, wodurch das Recycling von freiem LC3 erleichtert wird. Mit der breitesten Substratselektivität unter den ATG4-Paralogen bevorzugt ATG4B hauptsächlich LC3 und gleicht die Verlängerung, Verankerung der Autophagosomenmembran und den autophagischen Fluss aus. Seine Aktivität wird streng durch Redox-Modifikationen an Cys292 und Cys361 und durch Phosphorylierung reguliert, wodurch Autophagie an zellulären Stress angepasst wird; die Überexpression von Wildtyp-ATG4B kann die LC3-Lipidierung durch übermäßige Dekonjugation blockieren, während katalytisch inaktive Mutanten wie C74A LC3 sequestrieren und Autophagie hemmen. Eine Dysregulation der ATG4B-Aktivität ist aufgrund eines beeinträchtigten autophagischen Flusses mit der Tumorentstehung verbunden.

Nutzungsinformationen

Anwendung WB, FCM Verdünnung
WB FCM
1:1000 - 1:10000 1:100 - 1:500
Reaktivität Mouse, Human
Quelle Rabbit Monoclonal Antibody MW 44 kDa
Lagerpuffer PBS, pH 7.2+50% Glycerol+0.05% BSA+0.01% NaN3
Lagerung
(Ab dem Datum des Erhalts)
-20°C (avoid freeze-thaw cycles), 2 years
WB
Experimental Protocol:
 
Sample preparation
1. Tissue: Lyse the tissue sample by adding an appropriate volume of ice-cold RIPA/NP-40 Lysis Buffer (containing Protease Inhibitor Cocktail),and homogenize the tissue at a low temperature.
2. Adherent cell: Aspirate the culture medium and wash the cells with ice-cold PBS twice. Lyse the cells by adding an appropriate volume of RIPA/NP-40 Lysis Buffer (containing Protease Inhibitor Cocktail) and put the sample on ice for 5 min.
3. Suspension cell: Transfer the culture medium to a pre-cooled centrifuge tube. Centrifuge and aspirate the supernatant. Wash the cells with ice-cold PBS twice. Lyse the cells by adding an appropriate volume of RIPA/NP-40 Lysis Buffer (containing Protease Inhibitor Cocktail) and put the sample on ice for 5 min.
4. Place the lysate into a pre-cooled microcentrifuge tube. Centrifuge at 4°C for 15 min. Collect the supernatant;
5. Remove a small volume of lysate to determine the protein concentration;
6. Combine the lysate with protein loading buffer. Boil 20 µL sample under 95-100°C for 5 min. Centrifuge for 5 min after cool down on ice.
 
Electrophoretic separation
1. According to the concentration of extracted protein, load appropriate amount of protein sample and marker onto SDS-PAGE gels for electrophoresis. Recommended separating gel (lower gel) concentration: 10%. Reference Table for Selecting SDS-PAGE Separation Gel Concentrations
2. Power up 80V for 30 minutes. Then the power supply is adjusted (110 V~150 V), the Marker is observed, and the electrophoresis can be stopped when the indicator band of the predyed protein Marker where the protein is located is properly separated. (Note that the current should not be too large when electrophoresis, too large current (more than 150 mA) will cause the temperature to rise, affecting the result of running glue. If high currents cannot be avoided, an ice bath can be used to cool the bath.)
 
Transfer membrane
1. Take out the converter, soak the clip and consumables in the pre-cooled converter;
2. Activate PVDF membrane with methanol for 1 min and rinse with transfer buffer;
3. Install it in the order of "black edge of clip - sponge - filter paper - filter paper - glue -PVDF membrane - filter paper - filter paper - sponge - white edge of clip";
4. The protein was electrotransferred to PVDF membrane. ( 0.45 µm PVDF membrane is recommended ) Reference Table for Selecting PVDF Membrane Pore Size Specifications
Recommended conditions for wet transfer: 200 mA, 120 min.
( Note that the transfer conditions can be adjusted according to the protein size. For high-molecular-weight proteins, a higher current and longer transfer time are recommended. However, ensure that the transfer tank remains at a low temperature to prevent gel melting.)
 
Block
1. After electrotransfer, wash the film with TBST at room temperature for 5 minutes;
2. Incubate the film in the blocking solution for 1 hour at room temperature;
3. Wash the film with TBST for 3 times, 5 minutes each time.
 
Antibody incubation
1. Use 5% skim milk powder to prepare the primary antibody working liquid (recommended dilution ratio for primary antibody 1:1000), gently shake and incubate with the film at 4°C overnight;
2. Wash the film with TBST 3 times, 5 minutes each time;
3. Add the secondary antibody to the blocking solution and incubate with the film gently at room temperature for 1 hour;
4. After incubation, wash the film with TBST 3 times for 5 minutes each time.
 
Antibody staining
1. Add the prepared ECL luminescent substrate (or select other color developing substrate according to the second antibody) and mix evenly;
2. Incubate with the film for 1 minute, remove excess substrate (keep the film moist), wrap with plastic film, and expose in the imaging system.

Referenzen

  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28901328/
  • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35456009/

Anwendungsdaten

WB

Validiert von Selleck

  • F4916-wb
    Lane 1: Ramos, Lane 2: 293T, Lane 3: Jurkat, Lane 4: Hela