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CX-5461 (Pidnarulex) Inhibiteur de l'ARN Polymérase I

Name: CX-5461 (Pidnarulex)
Brand: Selleck Chemicals
SKU: S2684
Rating: 5 (83 reviews)

N° Cat.S2684

CX-5461 (Pidnarulex) est un inhibiteur de la synthèse de l'ARNr qui inhibe sélectivement la transcription de l'ARNr par la Pol I avec une IC50 de 142 nM dans les cellules HCT-116, A375 et MIA PaCa-2. Il n'a aucun effet sur la Pol II et possède une sélectivité de 250 à 300 fois pour l'inhibition de la transcription de l'ARNr par rapport à la réplication de l'ADN et à la traduction des protéines.

CX-5461 (Pidnarulex) DNA/RNA Synthesis inhibiteur Chemical Structure

Structure chimique

Poids moléculaire: 513.61

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Contrôle qualité

Lot : Pureté : 99.07%

99.07

Cibles apparentées	HDAC PARP ATM/ATR DNA-PK WRN Topoisomerase PPAR Sirtuin Casein Kinase eIF
Autre DNA/RNA Synthesis Inhibiteurs	B02 SCR7 Favipiravir (T-705) EED226 RK-33 BMH-21 Triapine (3-AP) Carmofur YK-4-279 Halofuginone

Culture cellulaire, traitement et concentration de travail

Lignées cellulaires	Type dessai	Concentration	Temps dincubation	Description de lactivité	PMID
MNNG	Cell viability assay		72 h	IC50=0.5-1.5 µM	27729807
U2-OS	Cell viability assay		72 h	IC50=0.5-1.5 µM	27729807
RS4;11	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
SEM	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
KOPN-8	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
NALM-6	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
NB-EBc1	qHTS assay			qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells	29435139
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Informations chimiques, stockage et stabilité

Poids moléculaire	513.61	Formule	C₂₇H₂₇N₇O₂S	Stockage (À partir de la date de réception)	3 ans-20°Cpoudre
N° CAS	1138549-36-6	Télécharger le SDF		Stockage des solutions mères	1 an-80°Cen solvant 1 mois-20°Cen solvant
Synonymes	N/A			Smiles	CC1=CN=C(C=N1)CNC(=O)C2=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C5=C(C2=O)C=CC(=N5)N6CCCN(CC6)C

Solubilité

In vitro
Lot:

DMSO : Insoluble
(Le DMSO contaminé par lhumidité peut réduire la solubilité. Utiliser du DMSO frais et anhydre.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calculateur de molarité

Masse	Concentration	Volume	Poids moléculaire
=	×	×

Calculateur de dilution Calculateur de poids moléculaire

In vivo Lot:
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Clear solution	5%DMSO 1 40%PEG300 2 5%Tween80 3 50%ddH2O Validé par les laboratoires Selleck. Si vous avez besoin dajustements à cette formulation, contactez notre équipe de vente pour des tests personnalisés.	0.150mg/ml (0.29mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 3 mg/ml clarified DMSO stock solution to 400 μL PEG300, mix evenly to clarify it; add 50 μL Tween80 to the above system, mix evenly to clarify it; then continue to add 500 μL ddH2O to adjust the volume to 1 mL. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Clear solution	5% DMSO 1 95% corn oil Validé par les laboratoires Selleck. Si vous avez besoin dajustements à cette formulation, contactez notre équipe de vente pour des tests personnalisés.	0.150mg/ml (0.29mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 3 mg/ml clear DMSO stock solution to 950 μL of corn oil and mix evenly. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Clear solution	5%DMF 1 40%PEG300 2 5%Tween80 3 50%ddH2O Validé par les laboratoires Selleck. Si vous avez besoin dajustements à cette formulation, contactez notre équipe de vente pour des tests personnalisés.	2.000mg/ml (3.89mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL 40 mg/ml clarified DMF stock solution to 400 μL PEG300, mix evenly to clarify it; add 50 μL Tween80 to the above system, mix evenly to clarify it; then continue to add 500 μL ddH2O to adjust the volume to 1 mL. . The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Clear solution	5%DMF 1 95%Corn oil Validé par les laboratoires Selleck. Si vous avez besoin dajustements à cette formulation, contactez notre équipe de vente pour des tests personnalisés.	2.000mg/ml (3.89mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 40 mg/ml clarified DMF stock solution to 950 μL of corn oil and mix evenly. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Clear solution	5%DMF 1 95%Corn oil Validé par les laboratoires Selleck. Si vous avez besoin dajustements à cette formulation, contactez notre équipe de vente pour des tests personnalisés.	2.000mg/ml (3.89mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 40 mg/ml clarified DMF stock solution to 950 μL of corn oil and mix evenly. The mixed solution should be used immediately for optimal results.

Calculateur de formulation in vivo (Solution claire)

Étape 1 : Entrez les informations ci-dessous (Recommandé : Un animal supplémentaire pour tenir compte des pertes pendant lexpérience)

Dosage : mg/kg Poids moyen des animaux : g Volume de dosage par animal :μL Nombre danimaux :

Étape 2 : Entrez la formulation in vivo (Ceci nest que le calculateur, pas la formulation. Veuillez nous contacter dabord sil ny a pas de formulation in vivo dans la section Solubilité.)

% DMSO + % + % Tween 80 + % ddH₂O

%DMSO+ %

Résultats du calcul :

Concentration de travail : mg/ml;

Méthode de préparation du liquide maître DMSO : mg médicament prédissous dans μL DMSO ( Concentration du liquide maître mg/mL, Veuillez nous contacter dabord si la concentration dépasse la solubilité du DMSO du lot de médicament. )

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuiteμL PEG300, mélanger et clarifier, ajouter ensuiteμL Tween 80, mélanger et clarifier, ajouter ensuite μL ddH₂O, mélanger et clarifier.

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuite μL Huile de maïs, mélanger et clarifier.

Remarque : 1. Assurez-vous que le liquide est clair avant dajouter le solvant suivant.
2. Assurez-vous dajouter le(s) solvant(s) dans lordre. Vous devez vous assurer que la solution obtenue lors de lajout précédent est une solution claire avant de procéder à lajout du solvant suivant. Des méthodes physiques telles que le vortex, les ultrasons ou le bain-marie peuvent être utilisées pour faciliter la dissolution.

Mécanisme daction

Targets/IC₅₀/Ki	Pol I-driven transcription of rRNA (HCT-116, A375, MIA PaCa-2 cells) 142 nM
In vitro	Le CX-5461 (Pidnarulex) inhibe sélectivement la synthèse de l'ARNr (Pol I IC50=142 nM ; Pol II IC50 > 25 μM ; sélectivité ~200 fois) dans les cellules HCT-116. Cette inhibition sélective est confirmée dans deux autres lignées cellulaires de tumeurs solides humaines : le mélanome A375 (Pol I IC50 = 113 nM ; Pol II IC50 > 25 μM) et le carcinome pancréatique MIA PaCa-2 (Pol I IC50=54 nM ; Pol II IC50 ~25 mM). Il possède une sélectivité de 250 à 300 fois pour l'inhibition de la transcription de l'ARNr par rapport à la réplication de l'ADN et à la traduction des protéines. Le composé présente une large puissance antiproliférative dans un panel de lignées cellulaires cancéreuses humaines, mais a un effet minimal sur la viabilité des cellules humaines non transformées. La CE50 médiane de toutes les lignées cellulaires testées est de 147 nM, tandis que toutes les lignées cellulaires normales ont des valeurs de CE50 d'environ 5 000 nM. L'évaluation de la réponse dose-dépendante antiproliférative pour les lignées cellulaires HCT-116, A375 et MIA PaCa-2 donne des valeurs de CE50 de 167, 58 et 74 nM. Il induit l'autophagie et la sénescence dans les cellules cancéreuses de tumeurs solides, plutôt que l'apoptose, par un processus indépendant de la p53.
Kinase Assay	Test de transcription Pol I et Pol II
Kinase Assay	Deux transcrits d'ARN à courte durée de vie (demi-vies ~20-30 minutes), l'un produit par la Pol I et l'autre par la Pol II, sont quantifiés par qRT-PCR comme mesure des effets liés au CX-5461 (Pidnarulex) sur la transcription. Le pré-ARNr 45S a servi de transcrit Pol I et l'ARNm du proto-oncogène c-myc a servi de transcrit Pol II comparatif. Il est connu que la transcription Pol I et Pol II est affectée par le stress cellulaire général. Pour minimiser les effets potentiels de ce stress, les cellules sont exposées aux agents testés pendant une courte période (2 heures) seulement. Ce temps est suffisant pour que ces transcrits soient réduits de plus de 90 % si ce composé affecte leur synthèse.
In vivo	Le CX-5461 (Pidnarulex) est biodisponible par voie orale et démontre une activité antitumorale in vivo contre les tumeurs solides humaines dans des modèles de xénogreffes murines. Ce composé démontre un TGI MIA PaCa-2 significatif avec un TGI égal à 69 % au jour 31. De même, il démontre un TGI A375 significatif avec un TGI égal à 79 % au jour 32.
Références	[1] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21159662/

Applications

Méthodes	Biomarqueurs	PMID
Western blot	Cyclin D1 / p53 / p16 53BP1 / γ-H2AX / p-ATM Bcl-2 / Bax / Caspase3 cleaved PARP / cleaved Caspase-9 / cleaved caspase-3 p-AMPK / AMPK / p-mTOR / mTOR EG5 / Histone H3 / p-Histone H3 (S10)	29631594
Immunofluorescence	Vimentin / Phalloidin / Snail1 Rictor / Calnexin Fibrillarin LC3 γH2AX / 53BP1 / RPA / RAD51 chromosome / telomere F-actin / Aurora B	31068593
Growth inhibition assay	Cell viability	26061708