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PCI-34051 HDAC8 Inhibiteur

N° Cat.S2012

PCI-34051 est un inhibiteur puissant et spécifique de l'HDAC8 avec une IC50 de 10 nM dans un essai sans cellule. Il présente une sélectivité supérieure à 200 fois par rapport à HDAC1 et 6, et supérieure à 1000 fois par rapport à HDAC2, 3 et 10. PCI-34051 induit l'apoptosis dépendante de la caspase.
PCI-34051 HDAC inhibiteur Chemical Structure

Structure chimique

Poids moléculaire: 296.32

Aller à

Contrôle qualité

Lot : Pureté : 99.79%
99.79

Culture cellulaire, traitement et concentration de travail

Lignées cellulaires Type dessai Concentration Temps dincubation Formulation Description de lactivité PMID
LAN1 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human LAN1 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=3.9μM 23116147
Jurkat Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human Jurkat cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=11μM 23116147
NB-1 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human NB-1 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=14μM 23116147
MT2 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human MT2 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=15μM 23116147
MT4 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human MT4 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=25μM 23116147
Huh7 Antiviral assay 3 days Antiviral activity against HCV genotype 1b infected in human Huh7 cells after 3 days by luciferase reporter gene assay, EC50=1.8μM 25490700
HuH7 Cytotoxicity assay 3 days Cytotoxicity against human HuH7 cells assessed as inhibition of cell viability after 3 days by CellTiter 96 assay, CC50=11μM 25490700
Sf9 Function assay 5 mins Inhibition of recombinant full-length human C-terminal FLAG-His-tagged HDAC1 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Boc-L-Lys(Ac)-AMC as substrate preincubated for 5 mins followed by substrate addition measured after 35 mins by fluoresce, IC50=3.8μM 28835796
Sf9 Function assay 5 mins Inhibition of recombinant human full-length C-terminal His-tagged HDAC3 (395 to 489 residues)/human NCOR2 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Boc-L-Lys(Ac)-AMC as substrate pretreated for 5 mins followed by substrate addition measured, IC50=7.1μM 28835796
Sf9 Function assay 5 mins Inhibition of recombinant human full-length C-terminal His-tagged HDAC2 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Boc-L-Lys(Ac)-AMC as substrate preincubated for 5 mins followed by substrate addition measured after 35 mins by fluorescence assay, IC50=31μM 28835796
SH-SY5Y Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human SH-SY5Y cells expressing TP53 by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
IMR5 Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human IMR5 cells expressing TP53 by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
SK-N-AS Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human SK-N-AS cells expressing TP53 mutation by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
Kelly Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human Kelly cells expressing TP53 mutation by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
BE(2)-C Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human BE(2)-C cells assessed as reduction in cell viability by measuring metabolic activity after 72 hrs by WST-8 assay, IC50=19.9μM 29190092
Sf9 Function assay 90 mins Inhibition of recombinant human full length C-terminal FLAG-tagged HDAC1 expressed in fall armyworm Sf9 cells using fluorogenic ZMAL as substrate after 90 mins by fluorimetric analysis, IC50=28.3μM 29190092
Sf9 Function assay 90 mins Inhibition of recombinant human full length HDAC6 expressed in fall armyworm Sf9 cells using fluorogenic ZMAL as substrate after 90 mins by fluorimetric analysis, IC50=48.2μM 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 72 hrs Inhibition of HDAC8 in human BE(2)-C cells assessed as upregulation of p21/CDKN1 gene expression at 6 uM after 72 hrs by RT-PCR analysis relative to control 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 72 hrs Inhibition of HDAC8 in human BE(2)-C cells assessed as upregulation of TrkA/NTRK1 gene expression at 6 uM after 72 hrs by RT-PCR analysis relative to control 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 72 hrs Inhibition of HDAC8 in human BE(2)-C cells assessed as upregulation of TH gene expression at 6 uM after 72 hrs by RT-PCR analysis relative to control 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 6 days Induction of outgrowth of neurofilament positive neutrite-like structures in human BE(2)-C cells at 6 uM after 6 days by DAPI-staining based microscopic analysis 29190092
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
Jurkat Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human Jurkat cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
HUT78 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human HUT78 cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
HSB2 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human HSB2 cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
MOLT4 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human MOLT4 cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
Jurkat Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human Jurkat cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=4.5μM 29533873
MOLT4 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human MOLT4 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=9.4μM 29533873
HEL Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HEL cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=10.8μM 29533873
SK-N-BE(2) Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human SK-N-BE(2) cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=16.9μM 29533873
PC3 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=19.2μM 29533873
K562 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human K562 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.01μM 30004697
K562R Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human K562R cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.2μM 30004697
HCT116 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.64μM 30004697
PC3 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.66μM 30004697
MCF7 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.97μM 30004697
BL21 (DE3) Function assay Binding affinity to human His-thioredoxin-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells by ITC method, Kd=0.0751μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=0.0777μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Binding affinity to Schistosoma mansoni His-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells by ITC method, Kd=0.367μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of Schistosoma mansoni His-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=0.4358μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL6/L179I mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=1μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL6 mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=1.63μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL1/mL6 mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=2.7μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL1/mL6/L179I mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=5μM 30347148
Sf9 Function assay Inhibition of C-terminal FLAG/His-tagged full length human HDAC1 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Z(Ac)Lys-AMC as substrate by fluorometric method, IC50=28.3μM 30347148
Sf9 Function assay Inhibition of N-terminal GST-tagged full length human HDAC6 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Z(Ac)Lys-AMC as substrate by fluorometric method, IC50=48.2μM 30347148
Sf9 Function assay 40 mins Inhibition of recombinant human full length C-terminal His-tagged HDAC8 expressed in baculovirus infected insect cells measured after 40 mins by HDAC-Glo1/2 luminescent assay, IC50=0.03162μM 30964290
SK-N-BE(2)C Anticlonogenic assay 96 hrs Anticlonogenic activity in human SK-N-BE(2)C cells assessed as reduction in cell proliferation incubated for 96 hrs by crystal violet staining based assay, GI50=15μM 31630054
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Informations chimiques, stockage et stabilité

Poids moléculaire 296.32 Formule

C17H16N2O3

Stockage (À partir de la date de réception)
N° CAS 950762-95-5 Télécharger le SDF Stockage des solutions mères

Synonymes N/A Smiles COC1=CC=C(C=C1)CN2C=CC3=C2C=C(C=C3)C(=O)NO

Solubilité

In vitro
Lot:

DMSO : 59 mg/mL (199.1 mM)
(Le DMSO contaminé par lhumidité peut réduire la solubilité. Utiliser du DMSO frais et anhydre.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calculateur de molarité

Masse Concentration Volume Poids moléculaire
Calculateur de dilution Calculateur de poids moléculaire

In vivo
Lot:

Calculateur de formulation in vivo (Solution claire)

Étape 1 : Entrez les informations ci-dessous (Recommandé : Un animal supplémentaire pour tenir compte des pertes pendant lexpérience)

mg/kg g μL

Étape 2 : Entrez la formulation in vivo (Ceci nest que le calculateur, pas la formulation. Veuillez nous contacter dabord sil ny a pas de formulation in vivo dans la section Solubilité.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Résultats du calcul :

Concentration de travail : mg/ml;

Méthode de préparation du liquide maître DMSO : mg médicament prédissous dans μL DMSO ( Concentration du liquide maître mg/mL, Veuillez nous contacter dabord si la concentration dépasse la solubilité du DMSO du lot de médicament. )

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuiteμL PEG300, mélanger et clarifier, ajouter ensuiteμL Tween 80, mélanger et clarifier, ajouter ensuite μL ddH2O, mélanger et clarifier.

Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuite μL Huile de maïs, mélanger et clarifier.

Remarque : 1. Assurez-vous que le liquide est clair avant dajouter le solvant suivant.
2. Assurez-vous dajouter le(s) solvant(s) dans lordre. Vous devez vous assurer que la solution obtenue lors de lajout précédent est une solution claire avant de procéder à lajout du solvant suivant. Des méthodes physiques telles que le vortex, les ultrasons ou le bain-marie peuvent être utilisées pour faciliter la dissolution.

Mécanisme daction

Targets/IC50/Ki
HDAC8
(Cell-free assay)
10 nM
In vitro

Le PCI-34051 possède une puissance prometteuse pour HDAC8 avec un Ki de 10 nM. Ce composé présente une sélectivité élevée (environ cinq fois) pour HDAC8 par rapport aux autres HDAC de classe I, y compris HDAC1. Il révèle une sélectivité supérieure à 200 fois par rapport à HDAC1 et HDAC6, et supérieure à 1000 fois par rapport à HDAC2, HDAC3 et HDAC10. Cette substance chimique inhibe la lignée tumorale ovarienne OVCAR-3 avec une GI50 de 6 μM et 15 % de mort cellulaire. Aucune acétylation significative de la tubuline ou de l'histone n'est observée dans les lignées cellulaires sensibles traitées avec ce composé à des concentrations inférieures à 25 μM à 24 heures ni à des temps plus précoces. Il induit un effet cytotoxique sélectif dans les lignées cellulaires dérivées uniquement de malignités des lymphocytes T. Ce composé induit une apoptose dépendante des caspases. Lorsque l'activité de la caspase-3 est mesurée à différents moments après le traitement avec 5 μM de cette substance chimique, des niveaux croissants d'activité sont observés de 12 à 24 à 48 heures, une autre caractéristique de l'apoptose, compatible avec les niveaux plus élevés d'activité de la caspase à ce moment. Il ne stimule pas le clivage de Bid, un effet caractéristique de la voie apoptotique extrinsèque. Alors que P116 et J.RT3-T.5 sont sensibles à ce composé, la lignée J.gamma1 déficiente en PLCγ1 révèle une diminution marquée de l'étendue de son apoptose induite. De plus, les niveaux de calcium à l'état stable influencent fortement l'apoptose induite par cette substance chimique. Il induit la libération du cytochrome c des mitochondries.

Kinase Assay
Activité histone désacétylase
Pour la caractérisation du PCI-34051, les mesures sont effectuées dans un volume de réaction de 100 μL en utilisant des plaques d'essai à 96 puits dans un lecteur de plaques de fluorescence. Pour chaque isozyme. La protéine HDAC dans le tampon de réaction (50 mM HEPES, 100 mM KCl, 0,001 % Tween-20, 5 % diméthylsulfoxyde, pH 7,4, complété par de la sérumalbumine bovine à des concentrations de 0-0,05 %) est mélangée avec ce composé à diverses concentrations et laissée incuber pendant 15 min. La trypsine est ajoutée à une concentration finale de 50 nM, et l'acétyl-gly-Ala-(N-acétyl-Lys)-amino-4-méthylcoumarine est ajoutée à une concentration finale de 25-100 μM pour initier la réaction. Après un temps de latence de 30 min, la fluorescence est mesurée sur une période de 30 min en utilisant une longueur d'onde d'excitation de 335 nm et une longueur d'onde de détection de 460 nm. L'augmentation de la fluorescence en fonction du temps est utilisée comme mesure du taux de réaction.
In vivo

Le PCI-34051 est un inhibiteur puissant et spécifique de l'histone désacétylase 8 (HDAC8).

Références

Applications

Méthodes Biomarqueurs Images PMID
Immunofluorescence SMC3 / Ac-SMC3
S2012-IF1
27072133

Support technique

Instructions de manipulation

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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