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Pracinostat (SB939) HDAC Inhibitor

Kat.-Nr.S1515

Pracinostat (SB939) ist ein potenter Pan-HDAC-Inhibitor mit IC50 von 40-140 nM, mit Ausnahme von HDAC6. Es hat keine Aktivität gegen das Klasse III Isoenzym SIRT I. Diese Verbindung induziert Apoptose in Tumorzellen. Phase 2.
Pracinostat (SB939) HDAC Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 358.48

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Qualitätskontrolle

Charge: Reinheit: 99.99%
99.99

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
MCF7 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.17 μM 24119555
NCI-H460 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human NCI-H460 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.22 μM 24119555
HCT116 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.24 μM 24119555
MDA-MB-435 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human MDA-MB-435 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.48 μM 24119555
OVCAR5 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human OVCAR5 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.61 μM 24119555
HepG2 Antimalarial assay Antimalarial activity against exo-erythrocytic form of Plasmodium berghei infected in human HepG2 cells, IC50 = 0.15 μM. 24904967
HepG2 Antiplasmodial assay 53 hrs Antiplasmodial activity against exoerythrocytic-stage of Plasmodium berghei ANKA infected in human HepG2 cells after 53 hrs by DAPI staining-based method, IC50 = 0.15 μM. 28241112
Sf9 Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-2 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
HEK293-F Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-8 expressed in HEK293-F cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
Sf9 Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-1 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht 358.48 Formel

C20H30N4O2

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 929016-96-6 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme N/A Smiles CCCCC1=NC2=C(N1CCN(CC)CC)C=CC(=C2)C=CC(=O)NO

Löslichkeit

In vitro
Charge:

DMSO : 72 mg/mL (200.84 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Ethanol : 27 mg/mL

Water : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Merkmale
A new histone deacetylase inhibitor based on hydroxamic acid, with improved physicochemical, pharmaceutical, and pharmacokinetic properties.
Targets/IC50/Ki
HDAC10
(Cell-free assay)
40 nM
HDAC3
(Cell-free assay)
43 nM
HDAC5
(Cell-free assay)
47 nM
HDAC1
(Cell-free assay)
49 nM
HDAC4
(Cell-free assay)
56 nM
HDAC9
(Cell-free assay)
70 nM
HDAC11
(Cell-free assay)
93 nM
HDAC2
(Cell-free assay)
96 nM
HDAC7
(Cell-free assay)
137 nM
HDAC8
(Cell-free assay)
140 nM
HDAC6
(Cell-free assay)
1.008 μM
In vitro

Pracinostat (SB939) weist eine 100-fach höhere Selektivität für HDACs auf als für Zn-bindende Nicht-HDAC-Enzyme, Rezeptoren und Ionenkanäle. Diese Verbindung ist ein potenter Inhibitor der HDAC-Klasse I Isoenzyme, HDAC1, HDAC2, HDAC3 und HDAC8 mit IC50-Werten im Bereich von 43 nM bis 140 nM. Es hemmt die HDAC-Klasse II Isoenzyme, HDAC4, HDAC5, HDAC7, HDAC9 und HDAC10 signifikant mit IC50-Werten im Bereich von 40 nM bis 137 nM, mit Ausnahme von HDAC6, das einen IC50 von 1008 nM aufweist. Es hemmt HDAC11 der HDAC-Klasse IV Enzyme deutlich mit einem IC50 von 93 nM, zeigt aber keine hemmende Aktivität gegen SIRT 1 der Klasse III HDACs. Diese Chemikalie zeigt eine signifikante antiproliferative Aktivität gegen eine Vielzahl von Tumorzelllinien, insbesondere Leukämiezellen und kutane T-Zell-Lymphomzellen, mit IC50-Werten im Bereich von 50 nM (H9-Zellen) bis 170 nM (HEL92.1.7-Zellen).

Kinase-Assay
HDAC-Enzymtest
Alle rekombinanten HDAC-Enzyme, mit Ausnahme von SIRT1, werden in S*BIO kloniert und exprimiert. Die Reaktionsmischung, die 2,5 oder 5 μL des HDAC-Isoenzyms, Assay-Puffer (25 mM Tris-HCl, pH 7,5; 137 mM NaCl; 2,7 mM KCl, 1 mM MgCl2 und 1 mg/mL BSA), verschiedene Konzentrationen dieser Verbindung und das fluorogene Deacetylase-Substrat Flour de LysTM in einem Gesamtreaktionsvolumen von 33 μL enthält, wird 2 Stunden bei Raumtemperatur inkubiert. 16 μL Flour de LysTM-Entwickler werden hinzugefügt und weitere 10 Minuten inkubiert. Das emittierte Licht wird bei 460 nm in einem Mikroplattenleser gemessen. IC50-Werte werden mit der XLfit-Software generiert.
In vivo

Die Verabreichung dieser Verbindung (25 mg/kg bis 100 mg/kg) zeigt eine dosisabhängige Antitumorwirksamkeit in einem Xenograft-Mausmodell für menschlichen Darmkrebs (HCT-116). Dies ist ungefähr doppelt so wirksam wie SAHA: diese Chemikalie bewirkt eine Tumorwachstumshemmung von 94 % gegenüber 48 % durch SAHA, beide bei der maximal verträglichen Dosis. Die orale Verabreichung dieses Mittels in einer Dosis von 50 mg/kg oder 75 mg/kg im APCmin genetischen Mausmodell für Darmkrebs im Frühstadium reduziert die Anzahl der Tumoren deutlich, verringert die kumulativen Hemoccult-Werte und erhöht die Hämatokritwerte effektiver.

Literatur

Anwendungen

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot p-JAK2 / JAK2 / p-STAT5 / STAT5 / p-FLT3 / FLT3
S1515-WB1
22829971

Klinische Studieninformationen

(Daten von https://clinicaltrials.gov, aktualisiert am 2024-05-22)

NCT-Nummer Rekrutierung Erkrankungen Sponsor/Kooperationspartner Startdatum Phasen
NCT02118909 Completed
Healthy Volunteers|Non-smokers
Helsinn Healthcare SA
May 2014 Phase 1
NCT02058784 Completed
Healthy Volunteers|Moderate to Heavy Smokers|Non-smokers
Helsinn Healthcare SA|Celerion
February 2014 Early Phase 1
NCT01112384 Completed
Metastatic Sarcoma
NCIC Clinical Trials Group|S*BIO|Canadian Cancer Trials Group
October 21 2010 Phase 2
NCT00741234 Completed
Solid Tumors|Hematologic Malignancies|Myelodysplastic Syndrome
S*BIO
April 2007 Phase 1

Technischer Support

Handhabungshinweise

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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