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Flavopiridol (Alvocidib, HMR-1275) CDK Inhibitor

Name: Flavopiridol (Alvocidib, HMR-1275)
Brand: Selleck Chemicals
SKU: S1230
Rating: 5 (146 reviews)

Kat.-Nr.S1230

Flavopiridol (Alvocidib) konkurriert mit ATP, um CDKs zu hemmen, einschließlich CDK1, CDK2, CDK4, CDK6 und CDK9 mit IC50-Werten im Bereich von 20-100 nM. Es ist selektiver für CDK1, 2, 4, 6, 9 im Vergleich zu CDK7. Flavopiridol hemmt ursprünglich EGFR und PKA. Flavopiridol induziert autophagy und ER-Stress. Flavopiridol blockiert die HIV-1-Replikation. Phase 1/2.

Flavopiridol (Alvocidib, HMR-1275) CDK Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 401.84

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Charge: Reinheit: 99.92%

99.92

Verwandte Ziele	HSP PD-1/PD-L1 ROCK Wee1 DNA/RNA Synthesis Microtubule Associated Ras KRas Aurora Kinase Casein Kinase
Weitere CDK Inhibitoren	AS2863619 Ro-3306 SEL120 (SEL120-34A) hydrochloride INX-315 Tagtociclib (PF-07104091) PF-07220060 (CDK4/6-IN-6) AZD4573 ON123300 Enitociclib (BAY 1251152) Samuraciclib (ICEC0942) hydrochloride

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien	Assay-Typ	Konzentration	Inkubationszeit	Aktivitätsbeschreibung	PMID
MCF-7 tumor cell	Proliferation assay			Inhibition of MCF-7 tumor cell proliferation	10843211
PC3 cell	Function assay			Inhibition of PC3 cell clonogenic assay, IC50=10 μM	11063609
HCT116 cell	Function assay			Inhibition of HCT116 cell clonogenic assay, IC50=13 μM	11063609
A2780 cell	Function assay			Inhibition of A2780 cell clonogenic assay， IC50=15 μM	11063609
Mia PaCa-2 cell	Function assay			Inhibition of Mia PaCa-2 cell clonogenic assay, IC50=36 μM	11063609
LNCaP human prostate carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of LNCaP human prostate carcinoma cell proliferation	12190313
HCT116/VP35 human colon carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of HCT116/VP35 human colon carcinoma cell proliferation, IC50=17 nM	12190313
HCT116 human colon carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of HCT116 human colon carcinoma cell proliferation, IC50=18 nM	12190313
HCT116/VM46 human colon carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of HCT116/VM46 human colon carcinoma cell proliferation, IC50=21 nM	12190313
A2780/DDP-R human ovarian carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of A2780/DDP-R human ovarian carcinoma cell proliferation, IC50=38 nM	12190313
ABAE human fibroblast cell	Proliferation assay			Inhibition of ABAE human fibroblast cell proliferation, IC50=45 nM	12190313
HL60 human leukemia cell	Proliferation assay			Inhibition of HL60 human leukemia cell proliferation, IC50=46 nM	12190313
Hs 27 human fibroblast cell	Proliferation assay			Inhibition of Hs 27 human fibroblast cell proliferation, IC50=51 nM	12190313
CCRF-CEM human leukemia cell	Proliferation assay			Inhibition of CCRF-CEM human leukemia cell proliferation, IC50=52 nM	12190313
OVCAR-3 human ovarian carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of OVCAR-3 human ovarian carcinoma cell proliferation, IC50=54 nM	12190313
A2780/DDP-S human ovarian carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of A2780/DDP-S human ovarian carcinoma cell proliferation, IC50=56 nM	12190313
A2780/TAX-S human ovarian carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of A2780/TAX-S human ovarian carcinoma cell proliferation, IC50=65 nM	12190313
LS174T human colon carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of LS174T human colon carcinoma cell proliferation, IC50=65 nM	12190313
MCF-7 human breast carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of MCF-7 human breast carcinoma cell proliferation, IC50=66 nM	12190313
PC3 human prostate carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of PC3 human prostate carcinoma cell proliferation, IC50=66 nM	12190313
MLF mouse lung fibroblast cell	Proliferation assay			Inhibition of MLF mouse lung fibroblast cell proliferation, IC50=72 nM	12190313
LX-1 human lung carcinoma	Proliferation assay			Inhibition of LX-1 human lung carcinoma proliferation, IC50=75 nM	12190313
A431 human squamous cell	Proliferation assay			Inhibition of A431 human squamous cell carcinoma cell proliferation, IC50=75 nM	12190313
SKBR-3 human breast carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of SKBR-3 human breast carcinoma cell proliferation, IC50=77 nM	12190313
A2780/TAX-R human ovarian carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of A2780/TAX-R human ovarian carcinoma cell proliferation, IC50=78 nM	12190313
M109 mouse lung carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of M109 mouse lung carcinoma cell proliferation, IC50=80 nM	12190313
CACO-2 human colon carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of CACO-2 human colon carcinoma cell proliferation, IC50=86 nM	12190313
A549 human lung carcinoma cell	Proliferation assay			Inhibition of A549 human lung carcinoma cell proliferation, IC50=96 nM	12190313
MIP human colon carcinoma cell	Function assay			Inhibition of MIP human colon carcinoma cell line, IC50=0.12 μM	12190313
K562 human leukemia cell	Proliferation assay			Inhibition of K562 human leukemia cell proliferation, IC50=0.13 μM	12190313
human A2780 cell line	Proliferation assay		72 h	Antiproliferative effect against human A2780 cell line was determined in a whole cell 72 hr cytotoxicity assay, IC50=71 nM	15027863
human ovarian (A2780) cancer cell	Cytotoxic assay			Cytotoxic effect on human ovarian (A2780) cancer cell line, IC50=71 nM	15125971
ID8 cells	Proliferation assay			Antiproliferative activity against ID8 cells, IC50=7 nM	17123821
MCF7 cells	Proliferation assay			Antiproliferative activity against MCF7 cells, IC50=26 nM	17123821
Sf9 cells	Function assay			Inhibition of recombinant cyclin A/CDK2 expressed in Sf9 cells, IC50=12 nM	17904366
human A2780 cells	Function assay			Inhibition of cdk-mediated NPM phosphorylation at thr199 in human A2780 cells	18469809
human A2780 cells	Function assay		24 h	Inhibition of cdk-mediated Rb phosphorylation at thr821 in human A2780 cells after 24 hrs	18469809
human NCI60 cells	Proliferation assay		72 h	Antiproliferative activity against human NCI60 cells after 72 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=74.7 nM	21080703
human NCI60 cells	Proliferation assay		72 h	Antiproliferative activity against human NCI60 cells assessed as lethal effect after 72 hrs by sulforhodamine B assay, LC50=0.904 μM	21080703
human A2780 cells	Cytotoxic assay		24 h	Cytotoxicity against human A2780 cells after 24 hrs by MTT assay, GI50=23 nM	23301767
human MRC5 cells	Cytotoxic assay		72 h	Cytotoxicity against human MRC5 cells after 72 hrs by MTT assay, GI50=28 nM	23301767
human A2780 cells	Cytotoxic assay		72 h	Cytotoxicity against human A2780 cells after 72 hrs by MTT assay, GI50=29 nM	23301767
human A2780 cells	Cytotoxic assay		48 h	Cytotoxicity against human A2780 cells after 48 hrs by MTT assay, GI50=31 nM	23301767
human MRC5 cells	Cytotoxic assay		48 h	Cytotoxicity against human MRC5 cells after 48 hrs by MTT assay, GI50=39 nM	23301767
human MRC5 cells	Cytotoxic assay		24 h	Cytotoxicity against human MRC5 cells after 24 hrs by MTT assay, GI50=49 nM	23301767
human HMEC1 cells	Cytotoxic assay		24 h	Cytotoxicity against human HMEC1 cells after 24 hrs by MTT assay, GI50=61 nM	23301767
human HMEC1 cells	Cytotoxic assay		48 h	Cytotoxicity against human HMEC1 cells after 48 hrs by MTT assay, GI50=62 nM	23301767
human HMEC1 cells	Cytotoxic assay		72 h	Cytotoxicity against human HMEC1 cells after 72 hrs by MTT assay, GI50=66 nM	23301767
A2780	Function assay	330 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in sb-G1 after 24 hr r at 330 nM (IC50), Cell cycle = 0.001 μM.	12190313
A2780	Apoptosis assay	330 nM	24 hr	Apoptotic A2780 cells after 24 hr r at 330 nM (IC50), Cell cycle = 0.001 μM.	12190313
A2780	Function assay	2980 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in sub-G1 after 24 hr r at 2980 nM (IC90), Cell cycle = 0.002 μM.	12190313
A2780	Apoptosis assay	2980 nM	24 hr	Apoptotic A2780 cells after 24 hr r at 2980 nM (IC90), Cell cycle = 0.009 μM.	12190313
A2780	Function assay	2980 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in S-phase after 24 hr r at 2980 nM (IC90), Cell cycle = 0.012 μM.	12190313
A2780	Function assay	330 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in S-phase after 24 hr r at 330 nM (IC50), Cell cycle = 0.016 μM.	12190313
A2780	Function assay	330 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in G2/M after 24 hr r at 330 nM (IC50), Cell cycle = 0.023 μM.	12190313
A2780	Function assay	2980 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in G2/M after 24 hr r at 2980 nM (IC90), Cell cycle = 0.025 μM.	12190313
A2780	Function assay	330 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in G1 after 24 hr r at 330 nM (IC50), Cell cycle = 0.06 μM.	12190313
A2780	Function assay	2980 nM	24 hr	Percentage A2780 cells in G1 after 24 hr r at 2980 nM (IC90), Cell cycle = 0.061 μM.	12190313
A2780	Function assay		24 hrs	Inhibition of cdk-mediated Rb phosphorylation at ser807/811 in human A2780 cells after 24 hrs	18469809
A2780	Function assay		24 hrs	Inhibition of cdk9-mediated RNA pol2 CTD phosphorylation at ser2 in human A2780 cells after 24 hrs	18469809
A2780	Function assay		24 hrs	Inhibition of cdk7-mediated RNA pol2 CTD phosphorylation at ser5 in human A2780 cells after 24 hrs	18469809
A2780	Apoptosis assay		24 hrs	Induction of apoptosis in human A2780 cells assessed as appearance of Mcl1 protein level after 24 hrs	18469809
DR-U2OS-GFP	Function assay	0.1 uM	56 hrs	Reduction of homologous recombination in human DR-U2OS-GFP cells expressing I-SceI nuclease assessed as reduction of RAD51 level at 0.1 uM after 56 hrs by immunoblotting	21417417
A2780	Function assay		24 hrs	Inhibition of CDK9 in human A2780 cells assessed as reduction of RNAPII CTD phosphorylation at Ser2 at GI50 concentration after 24 hrs by Western blotting analysis	23301767
A2780	Cell cycle assay		24 hrs	Cell cycle arrest in human A2780 cells assessed as accumulation at G2/M phase at less than GI50 after 24 hrs by flow cytometric analysis	23301767
A2780	Function assay		24 hrs	Inhibition of CDK9 in human A2780 cells assessed as downregulation of MCL1 at GI50 to 5XGI50 concentration after 24 hrs by Western blotting analysis	23301767
A2780	Apoptosis assay		24 hrs	Induction of apoptosis in human A2780 cells assessed as induction of PARP cleavage at GI50 to 5XGI50 concentration after 24 hrs by Western blotting analysis	23301767
A2780	Function assay		24 hrs	Inhibition of CDK9 in human A2780 cells assessed as downregulation of HDM2 at GI50 to 5XGI50 concentration after 24 hrs by Western blotting analysis	23301767
MT4	Antiproliferative assay			Antiviral activity against Human immunodeficiency virus 1 NL 4-3 infected in MT4 cells measured on day 4 post infection by p24 assay, EC50 = 0.015 μM.	25914804
MT4	Cytotoxicity assay			Cytotoxicity against human MT4 cells, IC50 = 0.067 μM.	25914804
Sf9	Function assay		15 mins	Inhibition of CDK2/cyclin E1 (unknown origin) expressed in Sf9 insect cells using UlightCFFKNIVTPRTPPPSQGK-amide substrate after 15 mins by autoradiography, IC50 = 0.13 μM.	25914804
A549	Antiproliferative assay		3 days	Antiproliferative activity against human A549 cells after 3 days by SRB method, GI50 = 0.14 μM.	25914804
DU145	Antiproliferative assay		3 days	Antiproliferative activity against human DU145 cells after 3 days by SRB method, GI50 = 0.15 μM.	25914804
KB	Antiproliferative assay		3 days	Antiproliferative activity against human KB cells after 3 days by SRB method, GI50 = 0.16 μM.	25914804
KBVIN	Antiproliferative assay		3 days	Antiproliferative activity against human KBVIN cells after 3 days by SRB method, GI50 = 0.18 μM.	25914804
HCT116	Antiproliferative assay		72 hrs	Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 72 hrs by Celltiter-Glo reagent based assay in presence of 10% fetal bovine serum, EC50 = 0.034 μM.	26985305
HCT116	Antiproliferative assay		72 hrs	Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 72 hrs by Celltiter-Glo reagent based assay in presence of 0.625% fetal bovine serum, EC50 = 0.059 μM.	26985305
Sf9	Function assay		10 mins	Inhibition of human His6-tagged CDK9/cyclin T1 expressed in baculovirus infected sf9 cells using GST-CTD as substrate after 10 mins in presence of [gamma-32P]ATP by SDS-PAGE analysis, IC50 = 0.0025 μM.	27171036
Sf21	Function assay			Inhibition of recombinant human full length C-terminal His6-tagged CDK9/cyclin T1 expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using PDKtide as substrate, IC50 = 0.011 μM.	27171036
HeLa	Cytotoxicity assay		72 hrs	Cytotoxicity against human HeLa cells assessed as decrease in cell viability after 72 hrs by MTT assay, CC50 = 0.12 μM.	27171036
sf21	Function assay			Inhibition of full length human N-terminal His6-tagged CDK6/N-terminal GST-tagged cyclin D3 expressed in sf21 cells using histone H1 substrate, IC50 = 0.395 μM.	27171036
Sf21	Function assay			Inhibition of recombinant human full length C-terminal His6-tagged CDK7/cyclin H/N-terminal GST-tagged MAT1 expressed in baculovirus infected Sf21 insect cells using cdk7 substrate peptide, IC50 = 0.514 μM.	27171036
HepG2	Antiproliferative assay		72 hrs	Antiproliferative activity against human HepG2 cells after 72 hrs by CelTiter-Glo assay, EC50 = 0.1464 μM.	29407975
KOPN8	Antiproliferative assay		72 hrs	Antiproliferative activity against human KOPN8 cells after 72 hrs by CelTiter-Glo assay, EC50 = 0.1926 μM.	29407975
SEM	Antiproliferative assay		72 hrs	Antiproliferative activity against human SEM cells after 72 hrs by CelTiter-Glo assay, EC50 = 0.2043 μM.	29407975
UOCB1	Antiproliferative assay		72 hrs	Antiproliferative activity against human UOCB1 cells after 72 hrs by CelTiter-Glo assay, EC50 = 0.2084 μM.	29407975
KOPN8	Apoptosis assay	0.5 uM	3 to 24 hrs	Induction of apoptosis in human KOPN8 cells assessed as upregulation of cleaved PARP level at 0.5 uM after 3 to 24 hrs by Western blot analysis	29407975
KOPN8	Apoptosis assay	0.5 uM	1 hr	Induction of apoptosis in human KOPN8 cells assessed as upregulation of cleaved PARP level at 0.5 uM pre-treated with NAC for 1 hr and measured after 3 to 24 hrs by Western blot analysis	29407975
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht	401.84	Formel	C₂₁H₂₀ClNO₅	Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)	3 Jahre-20°CPulver
CAS-Nr.	146426-40-6	SDF herunterladen		Lagerung von Stammlösungen	1 Jahr-80°Cin Lösungsmittel 1 Monat-20°Cin Lösungsmittel
Synonyme	NSC 649890, HMR-1275, L86-8275			Smiles	CN1CCC(C(C1)O)C2=C(C=C(C3=C2OC(=CC3=O)C4=CC=CC=C4Cl)O)O

Löslichkeit

In vitro
Charge:

DMSO : 80 mg/mL (199.08 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

DMSO : 80 mg/mL (199.08 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

DMSO : 30 mg/mL (74.65 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

DMSO : 80 mg/mL (199.08 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

DMSO : 80 mg/mL (199.08 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse	Konzentration	Volumen	Molekulargewicht
=	×	×

Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo Charge:
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Clear solution	5%DMSO 1 30%PEG300 2 65%ddH2O Von Selleck Labs validiert. Sollten Sie Anpassungen an dieser Formulierung benötigen, kontaktieren Sie unser Verkaufsteam für kundenspezifische Tests.	2.500mg/ml (6.22mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 50 mg/ml clarified DMSO stock solution to 300 μL of PEG 300, mix evenly to clarify it; then continue to add 650 μL of ddH2O to adjust the volume to 1 mL. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

Dosierung: mg/kg Durchschnittsgewicht der Tiere: g Dosiervolumen pro Tier:μL Anzahl der Tiere:

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO + % + % Tween 80 + % ddH₂O

%DMSO+ %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH₂O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Merkmale	First CDK inhibitor to be used in human clinical trials.
Targets/IC₅₀/Ki	CDK9 (Cell-free assay) 20 nM CDK1 (Cell-free assay) 30 nM CDK4 (Cell-free assay) 20-40 nM CDK2 (Cell-free assay) 40 nM CDK6 (Cell-free assay) 60 nM CDK7 (Cell-free assay) 875 nM
In vitro	Flavopiridol (Alvocidib) zeigt weniger Aktivität gegen nicht verwandte Kinasen wie MAP, PAK, PKC und EGFR mit einer IC50 von >14 μM. Es hemmt signifikant das Koloniewachstum von HCT116-, A2780-, PC3- und Mia PaCa-2-Zellen mit einer IC50 von 13 nM, 15 nM, 10 nM bzw. 36 nM. Diese Verbindung hemmt auch potent die Aktivität der Glykogensynthasekinase-3 (GSK-3) mit einer IC50 von 280 nM. Im Vergleich zu anderen CDKs hemmt es die Aktivität von CDK7 weniger potent mit einer IC50 von 875 nM. Bei 0,5 μM hemmt es sowohl pSer807/811 Rb als auch pThr199 NPM, während milde Veränderungen bei pThr821 Rb beobachtet werden. Es verringert auch den gesamten RNA-Polymerase-II-Spiegel sowie die Phosphorylierung der RNA-Polymerase II an den CTD-Wiederholungen bei Ser2 Ser5. Als Breitband-CDK-Inhibitor kann es den Cell Cycle in G1 oder G2 hemmen. Bei 0,3 μM induziert es einen G1-Arrest in MCF-7- oder MDA-MB-468-Zellen durch Hemmung der CDK4- oder CDK2-Kinaseaktivität. Es zeigt eine potente Zytotoxizität gegen eine Vielzahl von Tumorzelllinien mit IC50-Werten von 16 nM für LNCAP bis 130 nM für K562.
Kinase-Assay	CDK-Kinase-Assay
Kinase-Assay	Für den CDK1/Cyclin B1-Kinase-Assay bestehen die Kinase-Reaktionen aus 100 ng des im Baculovirus exprimierten GST-CDK1/Cyclin B1 (human)-Komplexes, 1 μg Histon HI, 0,2 μCi [γ-³³P]ATP, 25 μM ATP in 50 μL Kinase-Puffer (50 mM Tris, pH 8,0, 10 mM MgCl₂, 1 mM EGTA, 0,5 mM DTT). Für den CDK2/Cyclin E-Kinase-Assay bestehen die Kinase-Reaktionen aus 5 ng des im Baculovirus exprimierten GST-CDK2/Cyclin E (human)-Komplexes, 0,5 μg GST-RB-Fusionsprotein (Aminosäuren 776-928 des Retinoblastom-Proteins), 0,2 μCi [γ-³³P]ATP, 25 μM ATP in 50 μL Kinase-Puffer (50 mM Hepes, pH 8,0, 10 mM MgCl₂, 1 mM EGTA, 2 mM DTT). Für den CDK4/Cyclin D1-Kinase-Assay bestehen die Kinase-Reaktionen aus 150 ng des im Baculovirus exprimierten GST-CDK4/Cyclin D1 (human), 280 ng Stag-Cyclin D1, 0,5 μg GST-RB-Fusionsprotein (Aminosäuren 776-928 des Retinoblastom-Proteins), 0,2 μCi [γ-³³P]ATP, 25 μM ATP in 50 μL Kinase-Puffer (50 mM Hepes, pH 8,0, 10 mM MgCl₂, 1 mM EGTA, 2 mM DTT). Die Reaktionen werden 45 Minuten für CDK1 und CDK2 oder 1 Stunde für CDK4 bei 30 °C inkubiert und durch Zugabe von kalter Trichloressigsäure (TCA) bis zu einer Endkonzentration von 15 % gestoppt. TCA-Präzipitate werden auf GF/C-Unifilterplatten mit einem Filtermate Universal Harvester gesammelt und die Filter mit einem TopCount 96-Well Flüssigkeitsszintillationszähler quantifiziert. Flavopiridol (Alvocidib) wird in 10 mM in Dimethylformamid (DMF) gelöst und in sechs Konzentrationen, jeweils dreifach, evaluiert. Die Endkonzentration von DMF im Assay beträgt 2 %. Die IC50-Werte werden durch nichtlineare Regressionsanalyse abgeleitet und haben einen Variabilitätskoeffizienten von 16 %. Zur Bestimmung seiner Aktivität auf CDK6 wird ein Filterbindungsassay etabliert. Die folgenden Komponenten werden in der Reaktionsmischung kombiniert: 2 μL CDK6 (0,7 mg/μL), 5 μL Histon H1 (6 mg/mL), 14 μL Kinase-Puffer (60 mM β-Glycerophosphat, 30 mM p-Nitrophenylphosphat, 25 mM MOPS (pH 7,0), 5 mM EGTA, 15 mM MgCl₂, 1 mM DTT, 0,1 mM Na-Vanadat), 3 μL zunehmender Konzentrationen dieser in 50 % DMSO verdünnten Verbindung und 6 μL ³³P-ATP (1 mCi/mL) in nichtradioaktivem ATP bei 90 μM Konzentration (Endkonzentration: 15 μM). Der Assay wird durch Zugabe von ³³P-ATP initiiert. Die Reaktion wird 20 Minuten bei 30 °C inkubiert. Ein 25 μL Aliquot des Überstands wird dann auf Whatman P81 Phosphocellulose-Papier aufgetragen. Die Filter werden 5 Mal mit 1 %iger Phosphorsäurelösung gewaschen. Feuchte Filter werden in Gegenwart von 1 mL Szintillationsflüssigkeit gezählt. Die Cdk9-Aktivität wird unter Verwendung von 50 nM rekombinantem Cdk9/Cyclin T in 50 mM HEPES pH 7,5, 10 mM MgCl₂, 1 mM DTT, 3 μM Na₃VO₄, 150 μM RNA-Polymerase CDT-Peptid und 80 μM ATP gemessen. Der Cdk7-Assay wird im selben Puffer unter Verwendung von 37 nM gereinigter Kinase in Gegenwart von 200 μM ATP und 10 μM Myelin-Bindungsprotein als Substrat durchgeführt. Die Wirksamkeit gegenüber CDK9 und CDK7 wird entweder mittels eines starken Anionenaustauscher-(Dowex 1-X8 Harz, Formiat-Form)-basierten Assays oder eines Szintillationsproximity-Assays bestimmt. Die IC50-Werte werden aus den Dosis-Wirkungs-Kurven berechnet.
In vivo	Die Verabreichung von S1230 mit 7,5 mg/kg über 7 Tage zeigt eine leichte Antitumoraktivität gegen P388-Mausleukämie, was zu einem %T/C-Wert von 110 führt, und ist aktiv gegen das subkutan in Nacktmäuse implantierte humane A2780-Ovarialkarzinom, wobei ein 1,5 log cell kill (LCK) erzeugt wird. Die S1230-Behandlung mit 1-2,5 mg/kg über 10 Tage unterdrückt signifikant die kollageninduzierte Arthritis bei Mäusen dosisabhängig, indem sie die synoviale Hyperplasie und Gelenkzerstörung hemmt, während die Serumkonzentrationen von Anti-Kollagen Typ II (CII) Antikörpern und proliferative Reaktionen auf CII aufrechterhalten bleiben. In p21-intakten Hct116-Xenotransplantaten in Nacktmäusen hemmt die Verabreichung von CPT-11 (100 mg/kg) gefolgt von S1230 (3 mg/kg) 7 und 16 Stunden später die Tumorregression signifikant um 86 % bzw. 82 %, was eine >2-fache Hemmung im Vergleich zu CPT-11 allein um 40 % zeigt. Die Kombination führt zu einer kompletten Ansprechrate (CR) von ~30 %, im Gegensatz zu CPT-11 allein, wo keine CR gefunden wird.
Literatur	[1] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11063609/ [2] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15689157/ [3] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18469809/ [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8674031/ [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12190313/ [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18209094/ [7] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11751522/ [8] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18469809/ [9] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11311660/

Anwendungen

Methoden	Biomarker	Bilder	PMID
Western blot	Cleaved caspase-8 / Cleaved caspase-9 / Cleaved caspase-3 p-RNAPII / p-eIF4E / Mnk1 p-ERK / ERK / p-p38 / p-4EBP1 / 4EBP1 / p-S6 CDK2 / CDK4 / Cyclin A / p21 / p27 / Rb		31193061
Growth inhibition assay	Cell viability		31193061

Klinische Studieninformationen

(Daten von https://clinicaltrials.gov, aktualisiert am 2024-05-22)

NCT-Nummer	Rekrutierung	Erkrankungen	Sponsor/Kooperationspartner	Startdatum	Phasen
NCT03441555	Completed	Acute Myeloid Leukemia (AML)	AbbVie\|Sumitomo Pharma America Inc.	May 30 2018	Phase 1
NCT03298984	Completed	Acute Myeloid Leukemia	Sumitomo Pharma America Inc.	September 25 2017	Phase 1

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