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SGI-1027 DNA Methyltransferase Inhibitor

Kat.-Nr.S7276

SGI-1027 (DNA Methyltransferase Inhibitor II) ist ein DNMT-Inhibitor mit einer IC50 von 6, 8, 7,5 μM für DNMT1, DNMT3A bzw. DNMT3B in zellfreien Assays. Diese Verbindung induziert Apoptose.
SGI-1027 DNA Methyltransferase Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 461.52

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Qualitätskontrolle

Charge: Reinheit: 99.58%
99.58

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
human U937 cells Cytotoxicity assay 48 h Cytotoxicity against human U937 cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=1.7 μM
human KARPAS299 cells Proliferation assay 2-4 days Antiproliferative activity against human KARPAS299 cells after 2 to 4 days by ATPlite 1step luminescence assay, EC50=1.8 μM
human KG1 cells Proliferation assay 2-4 days Antiproliferative activity against human KG1 cells after 2 to 4 days by ATPlite 1step luminescence assay, EC50=4.4 μM
human MDA-MB-231 cells Cytotoxicity assay 48 h Cytotoxicity against human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=4.8 μM
human PC3 cells Cytotoxicity assay 48 h Cytotoxicity against human PC3 cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=6.5 μM
human Raji cells Cytotoxicity assay 48 h Cytotoxicity against human Raji cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=9.1 μM
human PBMC Cytotoxicity assay 48 h Cytotoxicity against human PBMC after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=23.8 μM
human HCT116 cells Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human HCT116 cells assessed as viability, TD50=25 μM
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht 461.52 Formel

C27H23N7O

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 1020149-73-8 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme DNA Methyltransferase Inhibitor II Smiles CC1=CC(=NC(=N1)N)NC2=CC=C(C=C2)NC(=O)C3=CC=C(C=C3)NC4=CC=NC5=CC=CC=C54

Löslichkeit

In vitro
Charge:

DMSO : 68 mg/mL (147.33 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Merkmale
Potential for use in epigenetic cancer therapy.
Targets/IC50/Ki
DNMT1
(Cell-free assay)
6 μM
DNMT3B
(Cell-free assay)
7.5 μM
DNMT3A
(Cell-free assay)
8 μM
In vitro

SGI-1027 hemmt die DNA-Methylierung durch direkte Hemmung von DNMTs und führt zu einem selektiven Abbau von DNMT1 in einer Vielzahl menschlicher Krebszelllinien. Diese Verbindung zeigt minimale oder keine zytotoxische Wirkung in Rattenhepatozytom H4IIE-Zellen.

Diese Chemikalie (0-100 μM) zeigt eine moderate pro-apoptotische Wirkung auf die menschliche Leukämiezelllinie U937 ohne relevante Veränderungen des Zellzyklus.

Kinase-Assay
DNA Methyltransferase (CpG Methyltransferase) Assay
Die DNA-Methylase-Aktivität wird durch Messung des Einbaus einer 3H1-Methylgruppe aus Ado-Met in DNA mittels DE-81-Ionenaustauschfilterbindungsassay mit einigen Modifikationen bestimmt. Menschliche rekombinante DNMT1, rekombinante Maus-Dnmt3a/Dnmt3b (500 ng) werden mit 500 ng Poly(dI-dC) oder hemimethylierter DNA-Duplex und 75 oder 150 nM (0,275 μCi oder 0,55 μCi) [Methyl-3H]-S-Adenosylmethionin (Ado-Met) in einem Gesamtvolumen von 50 μl bei 37 °C für 1 Stunde inkubiert. Alternativ wird M. Sss I im Puffer des Lieferanten getestet. Jede Reaktion wird doppelt durchgeführt und enthielt Kontrollen ohne Inhibitor oder ohne DNA. Die Reaktion wird gestoppt, indem das Reaktionsgemisch auf eine Whatman DE-81-Ionenaustauschfilterscheibe getropft, gewaschen (fünfmal, jeweils 10 Minuten, mit 0,5 M Na-Phosphatpuffer; pH 7,0), getrocknet und in einem Szintillationszähler gezählt wird. Die Hintergrundradioaktivität (Kontrolle ohne DNA) wird von den Werten subtrahiert, die mit Reaktionsmischungen erhalten wurden, die DNA enthielten, und die Radioaktivität, die in der Reaktion ohne Inhibitor erhalten wurde, wird als 100 % Aktivität betrachtet. Die IC50 wird durch Interpolation aus dem Diagramm des Prozentsatzes der Aktivität gegen die Inhibitorkonzentration bestimmt. Um die Art der Hemmung der DNMTase-Aktivität durch diese Verbindung zu bestimmen, wird die DNMT1-Enzymaktivität in Gegenwart einer festen Konzentration dieser Chemikalie (0, 2,5, 5 und 10 μM) gemessen, während einer der beiden (Ado-Met oder DNA) in einer bestimmten Reaktionsmischung variiert wurde. Bei einer festen Konzentration von DNA (500 ng) wurden variierende Konzentrationen von Ado-Met von 25-500 nM verwendet. Ähnlich wurden die endgültigen DNA-Konzentrationen von (25-500 ng) bei 75 nM Ado-Met variiert.
In vivo

SGI-1027 (DNA Methyltransferase Inhibitor II) ist ein DNMT Inhibitor .

Literatur

Anwendungen

Methoden Biomarker Bilder PMID
Growth inhibition assay Cell viability
S7276-viability1
30344731
Western blot Bcl-2 / Bax DNMT1 / TIMP3 / P16
S7276-WB1
30344731

Technischer Support

Handhabungshinweise

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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