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3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride EZH2-Inhibitor

Kat.-Nr.S7120

DZNeP (3-Deazaneplanocin A) HCl, ein Adenosin-Analogon, ist ein kompetitiver Inhibitor der S-Adenosylhomocystein-Hydrolase mit einem Ki von 50 pM in einem zellfreien Assay.
3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride Histone Methyltransferase Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 298.73

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Qualitätskontrolle

Charge: Reinheit: 99.92%
99.92

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
human PC3 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human PC3 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=9.39 μM. 26010585
human A549 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human A549 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=1.4 μM. 26010585
human SNU638 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human SNU638 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.91 μM. 26010585
human SKHEP1 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human SKHEP1 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.72 μM. 26010585
human MDA-MB-231 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human MDA-MB-231 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.3 μM. 26010585
human HCT116 cells Cytotoxic assay 72 h Cytotoxicity against human HCT116 cells assessed as inhibition of cell proliferation after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50=0.26 μM. 26010585
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht 298.73 Formel

C12H14N4O3.HCl

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 120964-45-6 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme NSC 617989 HCl Smiles C1=CN=C(C2=C1N(C=N2)C3C=C(C(C3O)O)CO)N.Cl

Löslichkeit

In vitro
Charge:

DMSO : 60 mg/mL (200.85 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : 60 mg/mL

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Merkmale
Carbocyclic analog of adenosine, and acts as anti-tumor and anti-virus inhibitor of EZH2.
Targets/IC50/Ki
S-adenosylhomocysteine hydrolase
50 pM(Ki)
In vitro

3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride (1,0 μM) führt zu einer signifikanten Zunahme der Akkumulation von Zellen in der G0/G1-Phase (58,5 %) bei gleichzeitiger Abnahme der Anzahl von Zellen in der S-Phase (35,2 %) und den G2/M-Phasen (6,3 %) des Zellzyklus von OCI-AML3-Zellen der akuten myeloischen Leukämie beim Menschen. Es induziert Apoptose in OCI-AML3- (~50 %) und HL-60-Zellen (~50 %) und eine mehr als 90-prozentige Verringerung des Koloniewachstums nach 48 Stunden. Es senkt die EZH2-Spiegel und hemmt die Trimethylierung von Lysin 27 auf Histon H3 in den HL-60- und OCI-AML3-Zellen sowie in primären AML-Zellen. Die Behandlung mit dem Wirkstoff induziert p16, p21, p27 und FBXO32 und senkt gleichzeitig die Cyclin-E- und HOXA9-Spiegel. 500 nM 3-Deazaneplanocin A induzieren die Differenzierung von HL-60 zu CD11b+-Zellen um fast das Dreifache nach 48 Stunden. Das Alkaloid zeigt zudem eine ausgezeichnete Wirksamkeit gegen mehrere Virustypen. Es wirkt gegen vesikuläre Stomatitis in L929-Zellen, Parainfluenza 3 in H.Ep-2 sowie Vaccinia- und Gelbfieberviren in Vero-Zellen mit einer IC50 von 0,2, 3,6, 2,1 bzw. 2,9 μg/ml. In der Studie zeigt es eine starke und gleichmäßige leishmanostatische Wirkung auf amerikanische Leishmania-Stämme (L. mexicana und L. brasiliensis) mit einer durchschnittlichen ID50 von 96 ng/ml, hemmt jedoch nicht die verschiedenen getesteten T. cruzi- und T. rangeli-Stämme bei Konzentrationen von bis zu 10 μg/ml. Bei einer Dosis von 200 ng/ml hemmt es nach vier Tagen die Einlagerung von S-Adenosyl-L-3H-Methylmethionin und 3-Thymidin durch Promastigoten. Bei einer Dosis von 100 ng/ml eliminiert es etwa 56 % der L. mexicana und L. brasiliensis aus infizierten menschlichen Makrophagen.

Kinase-Assay
S-Adenosylhomocystein-Hydrolase-Aktivitätsassay
Die für den AdoHcyase-Assay verwendete Reaktionsmischung enthält in einem Endvolumen von 0,5 ml 50 mM Kaliumphosphat (pH 7,6), 5 mM Dithiothreitol, 1 mM EDTA, 10 % Glycerin und das Enzym. Als Substrat wird L-[8- 14C]AdoHcy verwendet, und es sind 5 Einheiten Adenosindeaminase aus Kälberdarm enthalten. Die Reaktion wird durch Zugabe von 100 μl 5 M Ameisensäure gestoppt, und das Reaktionsgemisch wird dann auf eine Säule (0,8 × 2,5 cm) aus SP-Sephadex C-25 gegossen, die zuvor in 0,1 M Ameisensäure äquilibriert wurde. Jedes Reagenzglas wird mit 0,5 mL 0,1 M Ameisensäure gespült. Das gebildete [14C]Inosin wird mit 3,5 mL 0,1 M Ameisensäure aus der Säule in ein Szintillationsfläschchen eluiert. Die Radioaktivität wird nach Zugabe von 10 ml Szintillationsflüssigkeit bestimmt. Die verwendete Enzymmenge beträgt etwa 105 pU oder 75 ng des gereinigten Enzyms. Eine Einheit ist die Enzymmenge, die benötigt wird, um 1 pmol Produkt in 1 Minute bei 37 °C zu bilden.
In vivo

Es zeigt in vivo eine antileukämische Wirkung. In einer Dosierung von 8 mg/kg zeigt es in vivo eine antivirale Wirkung gegen das Vaccinia-Virus in einem Maus-Schwanzpocken-Test mit einem Medianwert von 0,0 poxftail (84 % Schutz). In Dosen von 0,5 bis 1,5 mg/kg/Tag reduzierte es signifikant die Entwicklung einer kutanen Leishmaniose-Infektion, die bei Inzucht-BALB/c-Mäusen durch Inokulation mit L. b. guyanensis hervorgerufen wurde. Es induziert eine massiv erhöhte Interferon-α-Produktion in mit dem Ebola-Virus infizierten Mäusen. Eine subkutane Injektion von 2 mg/kg nach der Infektion verhindert den Tod von Mäusen, die mit 1000 pfu (30 000 LD50) des an Mäuse angepassten EBO-Z infiziert wurden. Die Behandlung mit dem Wirkstoff am Tag 1 reduziert die mittleren Serumvirustiter am Tag 2 um das 100-Fache und am Tag 3 um das 100 000-Fache im Vergleich zu Placebo-Kontrollen und führt zu einem mittleren Serum-IFN-α-Spiegel von 1420 pg/ml am Tag 2 und 1830 pg/ml am Tag 3.

Literatur
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9347954/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12076759/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6639063/

Anwendungen

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot EZH2 / H3K27me3 Suz12 / H3K4me3 / H3K36me2 TGFBR1 / TGFBR2 / Smad3 EED / p21 / p-RB / p27 / p-CDC2 HOXA6 / HOXB3 / HOXC4 / HOXD13 p-JNK / JNK / p-p38 / p38 / p-ERK / ERK / p-IκB-α / IκB-α
S7120-WB1
27223261
Immunofluorescence α-tubulin F-actin / Paxillin EZH2 / Mst1
S7120-IF1
27226494
Growth inhibition assay Cell viability
S7120-viability1
27223261

Technischer Support

Handhabungshinweise

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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