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Bafilomycin A1 (Baf-A1) V-ATPase-Inhibitor

Kat.-Nr.S1413

Bafilomycin A1 (Baf-A1) ist ein vakuolärer H+-ATPase-Inhibitor mit einer IC50 von 0,44 nM, der Autophagy hemmt und gleichzeitig Apoptosis induziert.
Bafilomycin A1 (Baf-A1) Proton Pump Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 622.83

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Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
human H4 cells Function assay 0.4 μM 24 h Induction of light chain 3-GFP level in human H4 cells at 0.4 uM after 24 hrs by high throughput fluorescence microscopy relative to control 18024584
RAW 264.7 cells Function assay 100 nM Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as increased nitric oxide production in infected cells at 100 nM 19307359
mouse RAW264.7 cells Apoptosis assay 100 nM 16 h Induction of apoptosis in mouse RAW264.7 cells assessed as late apoptotic cells at 100 nM after 16 hrs using annexin V-propidium iodide staining by flow cytometry 19307359
human HeLa cells Function assay 400 nM Induction of autophagy in human HeLa cells expressing EGFP-LC3 assessed as increase in LC3-2 level at 400 nM 18391949
human MCF7 cells Function assay 4 h Inhibition of rapamycin-induced autophagy in human MCF7 cells expressing EGFP-LC3 assessed as decrease in EGFP levels at 100 nM after 4 hrs by Western blotting relative to control 20028134
RAW 264.7 cells Bactericidal activity assay 100 nM 16 h Bactericidal activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as decrease in bacterial growth yield at 100 nM after 16 hrs postinfection by flow cytometry in presence of 10 ug/ml of intracellular replication inhi 19307359
RAW 264.7 cells Antimicrobial activity assay 100 nM Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as increased nitric oxide production in infected cells at 100 nM 19307359
RAW 264.7 cells Antimicrobial activity assay 100 nM 30 mins Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as inhibition of bacterial replication at 100 nM treated 30 mins before infection measured after 2 to 16 hrs postinfection by flow cytometry 19307359
rat 3Y1 cells Function assay Induction of morphological changes in rat 3Y1 cells assessed as elongation of cells 29701963
human Huh7.5.1 cells Antiviral activity 3 h Antiviral activity against HCV genotype 2a JFH-1 in human Huh7.5.1 cells assessed as reduction of viral entry up to 3 hrs by luciferase assay 26396683
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht 622.83 Formel

C35H58O9

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 88899-55-2 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme N/A Smiles CC1CC(=CC=CC(C(OC(=O)C(=CC(=CC(C1O)C)C)OC)C(C)C(C(C)C2(CC(C(C(O2)C(C)C)C)O)O)O)OC)C

Löslichkeit

In vitro
Charge:

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Targets/IC50/Ki
H+-ATPase
(Cell-free assay)
0.44 nM
In vitro
Bafilomycin A1 (Baf-A1) ist ein toxisches Makrolid-Antibiotikum, das aus Streptomyces griseus gewonnen wird und den durch das äußere Mantel-Epithel (OME) induzierten Kurzschlussstrom hemmt. Die IC50 und die maximale Hemmdosis dieser Verbindung betragen 0,17 μM bzw. 0,5 μM. Darüber hinaus hemmt es den Säureeinstrom mit einem IC50-Wert von 0,4 nM. Es hemmt auch die Ansäuerung dosisabhängig, was zu einem geringeren Quenching und somit zu einer höheren Fluoreszenz führt. Diese Verbindung verhindert die Vakuolisierung von Hela-Zellen, die durch H. pylori induziert wird, mit einer inhibitorischen Konzentration, die 50 % des Maximalwerts (ID50) von 4 nM ergibt, und ist sehr effizient bei der Wiederherstellung eines normalen Aussehens vakuolisierter Zellen. Es beeinflusst auch den Transport von endozytiertem Material von frühen zu späten endozytischen Kompartimenten, indem es nicht nur den niedrigen endosomalen pH-Wert dissipiert, sondern auch den Transport von frühen zu späten Endosomen in HeLa-Zellen blockiert. In Dosen von 0,1-1 μM hemmt es die Ansäuerung von Lysosomen, die durch die Inkubation mit Acridinorange in BNL CL.2- und A431-Zellen sichtbar wird, vollständig. Bei Zugabe zu Hanks' balancierter Salzlösung wird der endogene Proteinabbau stark gehemmt und zahlreiche Autophagosomen reichern sich in H-4-II-E-Zellen an. Es verhindert auch das Auftreten von endozytiertem HRP in autophagischen Vakuolen.
Kinase-Assay
ATPase-Enzymaktivitäts-Assays
Das ATPase-Enzymassay-Medium enthält 6 mM MgSO4, 50 mM HEPES (pH 7,4), 200 mM Na2SO3 (V-ATPase-Aktivator), 0,5 mM Natriumorthovanadat (P-ATPase-Inhibitor), 0,5 mM Natriumazid (F-ATPase-Inhibitor) und 3 mM Na2ATP. Dieses Medium (1,0 mL), mit oder ohne Zusatz des V-type ATPase-Inhibitors Bafilomycin A1 (Baf-A1), wird mit dem filtrierten Homogenat (0,1 mL) 60 Minuten lang bei 23–25 °C inkubiert. Die Reaktion wird durch Zugabe von 1 mL TCA 3% gestoppt. Spektrometrische Leerwerte werden wie für den Enzymassay hergestellt, mit der Ausnahme, dass die Gewebeprobe nach der Säure hinzugefügt wird. Die Phosphatanalyse erfolgt durch Zugabe von 2 mL 1-Butanol und 0,2 mL Molybdatlösung (5 g Ammoniummolybdat, 22 mL H2SO4 auf 100 mL). Nach 15-sekündigem Vortexen wird die Lösung mit 0,5 mL Citratlösung (100 g/500 mL, pH 7,0) neutralisiert und erneut 15 Sekunden lang gevortext. Die Lösung wird dann zentrifugiert (2000 × g; 3 Minuten), um die Butanolphase zu trennen, und die Absorptionsrate dieser Phase wird bei 400 nm abgelesen. Orthophosphat-Standards werden hergestellt (0,1 μM–2,0 μM) und auf die gleiche Weise wie die Enzymaktivitätsassays behandelt. Die Enzymaktivität wird in μmol Orthophosphat pro Stunde und pro Milligramm Protein ausgedrückt. Die V-ATPase-Aktivität wird als die Differenz zwischen der gesamten ATPase-Aktivität, gemessen in Gegenwart von Na2SO3, Natriumorthovanadat und Natriumazid, und der ATPase-Aktivität, gemessen in Gegenwart dieser Reagenzien und dieser Verbindung, betrachtet.
In vivo
Bafilomycin A1 (Baf-A1) (1 μM und 0,1 μM) hemmt die resorptive Aktivität kultivierter Osteoklasten vollständig. Diese Verbindung hemmt dosisabhängig die Rate der Na+-Aufnahme bei jungen Tilapia mit einem Ki von 0,16 μM.
Literatur
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8446034/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9811698/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1832676/
  • [7] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9639028/
  • [8] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7817803/
  • [9] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10574743/
  • [10] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14713959/

Anwendungen

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot Ret / EGFR / p75 NGFR
S1413-WB1
21559479
Growth inhibition assay Cell viability
S1413-viability1
20534000
Immunofluorescence AIF LC3
S1413-IF1
25512644
ELISA TNF-alpha
S1413-ELISA1
26240140

Technischer Support

Handhabungshinweise

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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Häufig gestellte Fragen

Frage 1:
How to dissolve it?

Antwort:
S1413 is soluble in DMSO at 6 mg/ml. Please do not use alcohols as solvent, because this compound will degrade in alcohols.