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CX-5461 (Pidnarulex) RNA-Polymerase-I-Inhibitor

Kat.-Nr.S2684

CX-5461 (Pidnarulex) ist ein Inhibitor der rRNA synthesis, der die Pol I-gesteuerte Transkription von rRNA mit einer IC50 von 142 nM in HCT-116-, A375- und MIA PaCa-2-Zellen selektiv hemmt. Es hat keine Wirkung auf Pol II und besitzt eine 250- bis 300-fache Selektivität für die Hemmung der rRNA-Transkription gegenüber der DNA-Replikation und Proteintranslation.
CX-5461 (Pidnarulex) DNA/RNA Synthesis Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 513.61

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Qualitätskontrolle

Charge: Reinheit: 99.07%
99.07

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
MNNG Cell viability assay 72 h IC50=0.5-1.5 µM 27729807
U2-OS Cell viability assay 72 h IC50=0.5-1.5 µM 27729807
RS4;11 Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
SEM Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
KOPN-8 Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
NALM-6 Proliferation assay 250 nM 24 h time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls 26472108
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht 513.61 Formel

C27H27N7O2S

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 1138549-36-6 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme N/A Smiles CC1=CN=C(C=N1)CNC(=O)C2=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C5=C(C2=O)C=CC(=N5)N6CCCN(CC6)C

Löslichkeit

In vitro
Charge:

DMSO : Insoluble
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Targets/IC50/Ki
Pol I-driven transcription of rRNA
(HCT-116, A375, MIA PaCa-2 cells)
142 nM
In vitro

Es wird festgestellt, dass CX-5461 (Pidnarulex) die rRNA-Synthese (Pol I IC50=142 nM; Pol II IC50 > 25 ",mu"M; Selektivität ~200-fach) in HCT-116-Zellen selektiv hemmt. Diese selektive Hemmung wird in zwei anderen menschlichen soliden Tumorzelllinien bestätigt: Melanom A375 (Pol I IC50 = 113 nM; Pol II IC50 > 25 ",mu"M) und Pankreaskarzinom MIA PaCa-2 (Pol I IC50=54 nM; Pol II IC50 ~25 mM). Es besitzt eine 250- bis 300-fache Selektivität für die Hemmung der rRNA-Transkription im Vergleich zur DNA-Replikation und Protein-Translation. Die Verbindung zeigt eine breite antiproliferative Wirksamkeit in einem Panel von Krebszelllinien in menschlichen Krebszelllinien, hat aber minimale Auswirkungen auf die Lebensfähigkeit nicht-transformierter menschlicher Zellen. Der mediane EC50-Wert über alle getesteten Zelllinien beträgt 147 nM, während alle normalen Zelllinien EC50-Werte von etwa 5.000 nM aufweisen. Die Bewertung der antiproliferativen Dosis-Wirkungs-Beziehung für HCT-116-, A375- und MIA PaCa-2-Zelllinien ergibt EC50-Werte von 167, 58 und 74 nM. Es induziert Autophagie und Seneszenz in soliden Tumorkrebszellen, anstatt Apoptose, durch einen p53-unabhängigen Prozess.

Kinase-Assay
Pol I- und Pol II-Transkriptionsassay
Zwei kurzlebige RNA-Transkripte (Halbwertszeiten ~20-30 Minuten), eines von Pol I und ein weiteres von Pol II produziert, werden mittels qRT-PCR als Maß für CX-5461 (Pidnarulex)-bezogene Effekte auf die Transkription quantifiziert. Die 45S prä-rRNA diente als Pol I-Transkript und die mRNA für das Protoonkogen c-myc diente als vergleichendes Pol II-Transkript. Es ist bekannt, dass sowohl die Pol I- als auch die Pol II-Transkription durch allgemeinen zellulären Stress beeinflusst werden. Um die potenziellen Auswirkungen eines solchen Stresses zu minimieren, werden die Zellen nur für eine kurze Zeit (2 Stunden) Testsubstanzen ausgesetzt. Dies ist ausreichend Zeit, damit diese Transkripte um mehr als 90 % reduziert werden, wenn diese Verbindung ihre Synthese beeinflusst.
In vivo

CX-5461 (Pidnarulex) ist oral bioverfügbar und zeigt in vivo Antitumoraktivität gegen menschliche solide Tumoren in murinen Xenograftmodellen. Diese Verbindung zeigt eine signifikante MIA PaCa-2 TGI mit einem TGI von 69 % am Tag 31. Ebenso zeigt sie eine signifikante A375 TGI mit einem TGI von 79 % am Tag 32.

Literatur

Anwendungen

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot Cyclin D1 / p53 / p16 53BP1 / γ-H2AX / p-ATM Bcl-2 / Bax / Caspase3 cleaved PARP / cleaved Caspase-9 / cleaved caspase-3 p-AMPK / AMPK / p-mTOR / mTOR EG5 / Histone H3 / p-Histone H3 (S10)
S2684-WB1
29631594
Immunofluorescence Vimentin / Phalloidin / Snail1 Rictor / Calnexin Fibrillarin LC3 γH2AX / 53BP1 / RPA / RAD51 chromosome / telomere F-actin / Aurora B
S2684-IF1
31068593
Growth inhibition assay Cell viability
S2684-viability1
26061708

Klinische Studieninformationen

(Daten von https://clinicaltrials.gov, aktualisiert am 2024-05-22)

NCT-Nummer Rekrutierung Erkrankungen Sponsor/Kooperationspartner Startdatum Phasen
NCT02719977 Completed
Cancer
Canadian Cancer Trials Group|Senhwa Biosciences Inc.|Stand Up To Cancer
June 13 2016 Phase 1

Technischer Support

Handhabungshinweise

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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Häufig gestellte Fragen

Frage 1:
I want to make it for further in vivo treatment.

Antwort:
This compound has poor solubility in common vehicles. It can be dissolved in DMF at 3 mg/ml with warming.