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Belinostat (PXD101) HDAC Inhibitor

Kat.-Nr.: S1085

Belinostat ist ein neuartiger HDAC-Inhibitor mit einer IC50 von 27 nM in einem zellfreien Assay, dessen Aktivität in Cisplatin-resistenten Tumoren nachgewiesen wurde. Belinostat (PXD101) induziert Autophagy.
Belinostat (PXD101) HDAC Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 318.35

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Qualitätskontrolle (Quality Control)

Charge: Reinheit: 99.74%
99.74

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
HCT116 Function Assay 0.9 μM  24 h down-regulats TS protein levels after 6 h incubation 17124594
HCT116 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=0.28 μM 17124594
Granta-519 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=56.3 μM 20068080
Jeko-1 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=0.2 μM 20068080
HBL-2 Growth Inhibition Assay 24 h IC50=0.4 μM 20068080
Panc-1  Apoptosis Assay 100/500/1000 nM 48 h induces dose dependent apoptosis 22681698
AsPC-1 Apoptosis Assay 100/500/1000 nM 48 h induces dose dependent apoptosis 22681698
T3M4 Apoptosis Assay 100/500/1000 nM 48 h induces dose dependent apoptosis 22681698
Panc-1  Growth Inhibition Assay 0-800 nM 48 h inhibits cell proliferation in a dose dependent manner 22681698
AsPC-1 Growth Inhibition Assay 0-800 nM 48 h inhibits cell proliferation in a dose dependent manner 22681698
T3M4 Growth Inhibition Assay 0-800 nM 48 h inhibits cell proliferation in a dose dependent manner 22681698
MiaPaCa2 Function Assay 1/10 μM 24 h induces growth arrested in G2/M 23475695
AsPc1 Function Assay 1/10 μM 24 h induces growth arrested in G2/M 23475695
Panc0403 Apoptosis Assay 1 μM 24 h induces apoptosis 23475695
Panc1005 Apoptosis Assay 1 μM 24 h induces apoptosis 23475695
Panc0327 Apoptosis Assay 1 μM 24 h induces apoptosis 23475695
Panc0203 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=22.2 μM 23475695
PL45 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=20.8 μM 23475695
Panc1005 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=1.1 μM 23475695
Panc0403 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=1.1 μM 23475695
BxPc3 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=1.0 μM 23475695
MiaPaCa2 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=0.7 μM 23475695
Panc0327 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=0.5 μM 23475695
AsPc1 Growth Inhibition Assay 48 h EC50=0.3 μM 23475695
PC9 Function Assay 0.5/1/2 μM 4 h DMSO inhibits the levels of Akt (p-Akt) and EGFR 23515752
H1650 Function Assay 0.5/1/2 μM 4 h DMSO inhibits the levels of Akt (p-Akt) and EGFR 23515752
H460 Function Assay 0.5/1/2 μM 4 h DMSO inhibits the levels of Akt (p-Akt) and EGFR 23515752
PC9 Function Assay 500 nM 24 h DMSO decreases EGFR expression 23515752
H1650 Function Assay 500 nM 24 h DMSO decreases EGFR expression 23515752
H460 Function Assay 500 nM 24 h DMSO decreases EGFR expression 23515752
HCC4006 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.46 μM 23515752
HCC2935 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.97 μM 23515752
HCC827 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.29 μM 23515752
HCC2279 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.4 μM 23515752
PC9 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.29 μM 23515752
H820 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.4 μM 23515752
H1650 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.88 μM 23515752
H1975 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.68 μM 23515752
H520 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.75 μM 23515752
H1299 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=1.2 μM 23515752
H460 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50=0.86 μM 23515752
H1666 Growth Inhibition Assay 72 h DMSO IC50>10 μM 23515752
PANC-1 Function Assay 10 μM 2/4 h DMSO increases intracellular ROS level 23743198
PANC-1 Cell Viability Assay 1/10 μM 48 h DMSO decreases cell viability in a dose dependent manner 23743198
PANC-1 Function Assay 10 μM 2/4/6 h DMSO induces AMPK activation 23743198
HL-60  Function Assay 0.2 μM 24/48/72 h enhances RA-induced granulocytic differentiation 25864732
NB4 Function Assay 0.2 μM 24/48/72 h enhances RA-induced granulocytic differentiation 25864732
HL-60  Function Assay 2 μM 24/48 h blocks cell cycle in S phase 25864732
NB4 Function Assay 2 μM 24/48 h blocks cell cycle in S phase 25864732
HL-60  Cell Viability Assay 0.2/2 μM 24/48/72 h decreases cell viability in both time and dose dependent manner 25864732
NB4 Cell Viability Assay 0.2/2 μM 24/48/72 h decreases cell viability in both time and dose dependent manner 25864732
RAW264.7 Anti-inflammatory assay 1 hr Anti-inflammatory activity in LPS-stimulated mouse RAW264.7 cells assessed as suppression of IL6 production pre-incubated for 1 hr before LPS stimulation for 24 hrs by ELISA method, IC50 = 0.000059 μM. 25113875
HEK293 Function assay Inhibition of HDAC6 in HEK293 cells, IC50 = 0.015 μM. 18308563
HEK293 Function assay Inhibition of HDAC1 in HEK293 cells, IC50 = 0.018 μM. 18308563
HeLa Function assay 30 mins Inhibition of HDAC in human HeLa cells nuclear extracts incubated for 30 mins by fluorescent assay, IC50 = 0.0264 μM. 25113875
HeLa Function assay Inhibition of HDAC in human HeLa cells using Fluor de Lys as substrate by fluorescence assay, IC50 = 0.027 μM. 23639537
HeLa Function assay Inhibition of HDAC from human HeLa cells, IC50 = 0.028 μM. 18247554
HEK293 Function assay Inhibition of HDAC3 in HEK293 cells, IC50 = 0.046 μM. 18308563
MDA-MB-231 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MDA-MB-231 cells after 72 hrs by resazurin dye based fluorescence assay, IC50 = 0.062 μM. 29456804
Jurkat Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human Jurkat cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 0.07 μM. 29533873
A549 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human A549 cells after 72 hrs by resazurin dye based fluorescence assay, IC50 = 0.077 μM. 29456804
HeLa Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HeLa cells after 72 hrs by resazurin dye based fluorescence assay, IC50 = 0.087 μM. 29456804
MCF7 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 72 hrs by resazurin dye based fluorescence assay, IC50 = 0.096 μM. 29456804
HEL Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HEL cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 0.1 μM. 29533873
Huh7 Antiviral assay 3 days Antiviral activity against HCV genotype 1b infected in human Huh7 cells after 3 days by luciferase reporter gene assay, EC50 = 0.12 μM. 25490700
HCT116 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 48 hrs by SRB assay, GI50 = 0.13 μM. 27344487
MOLT4 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human MOLT4 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 0.14 μM. 29533873
HCT116 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human HCT116 cells assessed as growth inhibition, IC50 = 0.16 μM. 21650221
HCT116 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human HCT116 cells, IC50 = 0.16 μM. 21742496
SK-N-BE(2) Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human SK-N-BE(2) cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 0.31 μM. 29533873
PC3 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 48 hrs by SRB assay, GI50 = 0.39 μM. 27344487
PC3 Antiproliferative assay 96 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 96 hrs by celltiter 96 assay, IC50 = 0.45 μM. 21634430
H1299 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human H1299 cells, IC50 = 0.46 μM. 21650221
HeLa Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HeLa cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 0.51 μM. 29533873
HCT116 Antiproliferative assay 96 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 96 hrs by celltiter 96 assay, IC50 = 0.6 μM. 21634430
A2780 Antiproliferative assay 96 hrs Antiproliferative activity against human A2780 cells after 96 hrs by celltiter 96 assay, IC50 = 0.67 μM. 21634430
HuH7 Cytotoxicity assay 3 days Cytotoxicity against human HuH7 cells assessed as inhibition of cell viability after 3 days by CellTiter 96 assay, CC50 = 0.68 μM. 25490700
COLO205 Antiproliferative assay 96 hrs Antiproliferative activity against human COLO205 cells after 96 hrs by celltiter 96 assay, IC50 = 0.7 μM. 21634430
A549 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human A549 cells after 48 hrs by SRB assay, GI50 = 0.78 μM. 27344487
HL60 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HL60 cells after 48 hrs by SRB assay, GI50 = 1.09 μM. 27344487
K562 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human K562 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 1.1 μM. 29533873
PC3 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50 = 1.3 μM. 29533873
NFF Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human NFF cells after 72 hrs by SRB assay, IC50 = 1.4 μM. 28241112
HEK293 Cytotoxicity assay 48 hrs Cytotoxicity against HEK293 cells after 48 hrs by resazurin assay, IC50 = 1.4 μM. 28241112
NFF Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human NFF cells after 72 hrs by sulforhodamine B assay, IC50 = 1.42 μM. 30245402
HEK293 Cytotoxicity assay 48 hrs Cytotoxicity against HEK293 cells after 48 hrs by resazurin dye based assay, IC50 = 1.42 μM. 30245402
RAW264.7 Anti-inflammatory assay 1 hr Anti-inflammatory activity in LPS-stimulated mouse RAW264.7 cells assessed as suppression of nitric oxide production pre-incubated for 1 hr before LPS stimulation for 24 hrs by Griess reagent based assay, IC50 = 2.2 μM. 25113875
RAW264.7 Anti-inflammatory assay 1 hr Anti-inflammatory activity in LPS-stimulated mouse RAW264.7 cells assessed as suppression of TNFalpha production pre-incubated for 1 hr before LPS stimulation for 24 hrs by ELISA method, IC50 = 4.7 μM. 25113875
RAW264.7 Anti-inflammatory assay 1 hr Anti-inflammatory activity in LPS-stimulated mouse RAW264.7 cells assessed as suppression of PGE2 production pre-incubated for 1 hr before LPS stimulation for 24 hrs by enzyme immunoassay method, IC50 = 8.28 μM. 25113875
Huh-luc/neo7 Function assay 1 uM 1 to 3 hrs Inhibition of HDAC class 1 in human Huh-luc/neo7 cells assessed as histone H3 acetylation at 1 uM after 1 to 3 hrs by Western blotting analysis 25937017
PC3 Function assay 0.3 uM 48 hrs Inhibition of HDAC in human PC3 cells assessed as increase in amount of acetylated histone H3 at 0.3 uM after 48 hrs by Western blot analysis 27344487
HCT116 Function assay 0.3 uM 48 hrs Inhibition of HDAC in human HCT116 cells assessed as increase in amount of acetylated histone H3 at 0.3 uM after 48 hrs by Western blot analysis 27344487
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität (Chemical Information, Storage & Stability)

Molekulargewicht 318.35 Formel

C15H14N2O4S

 Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 866323-14-0 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Synonyme PXD101,NSC726630, PX-105684 Smiles C1=CC=C(C=C1)NS(=O)(=O)C2=CC=CC(=C2)C=CC(=O)NO

Löslichkeit (Solubility)

In vitro
Charge:

DMSO : 64 mg/mL (201.03 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus (Mechanism of Action)

Merkmale
Lead compound of Topotarget.
Targets/IC50/Ki
HDAC
(Cell-free assay)
27 nM
In vitro
Belinostat inhibits the growth of tumor cells (A2780, HCT116, HT29, WIL, CALU-3, MCF7, PC3 and HS852) with IC50 from 0.2-0.66 μM. PD101 shows low activity in A2780/cp70 and 2780AD cells, which are cisplatin and doxorubicin-resistant derivatives of A2780 cells. This compound could induce apoptosis through PARP cleavage and acetylation of histones H3/H4. It inhibits bladder cancer cell growth, especially in 5637 cells, which shows accumulation of G0-G1 phase, decrease in S phase and increase in G2-M phase. The growth inhibitory activity of this chemical on cell lines is not strongly influenced by the multidrug-resistant phenotype, whereas the activity of docetaxel is clearly affected. It could enhance the growth inhibitory activity of docetaxel or carboplatin in OVCAR-3 and A2780 cells. This compound also shows enhanced tubulin acetylation in ovarian cancer cell lines. A recent study shows that it activates protein kinase A in a TGF-β signaling-dependent mechanism and decreases survivin mRNA.
Kinase-Assay
Histon-Deacetylase-Aktivität
Subkonfluente Kulturen werden geerntet und zweimal in eiskaltem PBS gewaschen und durch Zentrifugation bei 200 × g für 5 min pelletiert. Das Zellpellet wird in zwei Volumina Lysepuffer [60 mM Tris-Puffer (pH 7,4) mit 30 % Glycerin und 450 mM NaCl] resuspendiert und durch drei Gefrier- (Trockeneis) Tau- (30 °C Wasserbad) Zyklen lysiert. Zelltrümmer werden durch Zentrifugation bei 1,2 × 104 g für 5 min entfernt, und der Überstand wird bei –80 °C gelagert. Histon-H4-Peptid (Sequenz SGRGKGGKGLGKGGAKRHRK, entsprechend den 20 NH2-terminalen Resten) wird durch ein rekombinantes Protein, das die Hypoxanthin-Aminopterin-Thymidin-Domäne von p300 enthält, unter Verwendung von [3H]-Acetyl-CoA als Acetatquelle acetyliert. H4-Peptid (100 μg) wird mit Hypoxanthin-Aminopterin-Thymidin-Puffer (50 mM Tris HCl pH 8,0, 5 % Glycerin, 50 mM KCl und 0,1 mM EDTA), 1 mM DTT, 1 mM 4-(2-Aminoethyl)benzolsulfonylfluorid, 1 × kompletten Proteaseinhibitoren, 50 μL gereinigtem p300 und 1,85 m [3H]-Acetyl-CoA (4,50 Ci/mmol) in einem Endvolumen von 300 μL gemischt und bei 30 °C für 45 min inkubiert. Das p300-Protein wird durch Inkubation mit 20 μL 50 % Ni-Agarose-Beads für 1 Stunde bei 4 °C und Zentrifugation entfernt. Der Überstand wird auf eine 2 mL Sephadex G15-Säule aufgetragen, und der Durchfluss wird gesammelt. Ein Milliliter destilliertes H2O wird vorsichtig aufgetragen, und drei Tropfenfraktionen werden gesammelt; dies wird wiederholt, bis 4–5 mL destilliertes H2O hinzugefügt wurden und ~40 Fraktionen gesammelt werden. Drei Mikroliter jeder Fraktion werden in 2 mL Szintillationsflüssigkeit verdünnt und in einem Szintillationszähler gezählt, um die Fraktionen mit dem markierten Peptid zu identifizieren. Diese Fraktionen werden gepoolt, und 1 μL der kombinierten Probe wird gemessen, um die Radioaktivität in jeder Peptidcharge zu bestimmen (3-7×103 cpm/μL). Für Aktivitätstests wird die Reaktion in einem Gesamtvolumen von 150 μL Puffer [60 mM Tris (pH 7,4) mit 30 % Glycerin] mit 2 μL Zellextrakt und, falls verwendet, 2 μL dieser Verbindung durchgeführt. Die Reaktion wird durch Zugabe von 2 μL [3H]-markiertem Substrat (acetyliertes Histon-H4-Peptid, das den 20 NH2-terminalen Resten entspricht) gestartet. Die Proben werden 45 min bei 37 °C inkubiert, und die Reaktion wird durch Zugabe von HCl und Essigsäure (Endkonzentrationen von 0,72 bzw. 0,12 M) gestoppt. Freigesetztes [3H]-Acetat wird in 750 μL Ethylacetat extrahiert, und die Proben werden bei 1,2 × 104 g für 5 min zentrifugiert. Die obere Phase (600 μL) wird in 3 mL Szintillationsflüssigkeit überführt und gezählt.
In vivo
Belinostat indicates significant tumor growth delay in A2780 and A2780/cp70 xenograft at a dose of 10mg/kg with no effects on the body weight. This compound also induces p21WAF1, HDAC core and cell communication genes in mouse bladder tumors. Its monotherapy induces dose-proportional antitumor effects with TGI of 47% at a dose of 100mg/kg in A2780 xenograft. The combination of this chemical (100 mg/kg) with carboplatin (40 mg/kg) could delay tumor growth from 18.6 days to 22.5 days. Combining with bortezomib, it results in great tumor inhibition and gastrointestinal toxicity in mice with bortezomib-resistant UMSCC-11A xenograft.
Literatur
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21757750/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17237265/

Anwendungen (Applications)

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot p-H2AX(Ser139) / KU70 / KU80 / RAD51 / RAD52 / ERCC1 Acetyl Histone H3 / Acetyl Histone H4 / Acetyl tubulin p21 / p27 SOS1 / SOS2 PARP / p-ERK / p-p38 / p38 / p-BRAF / p-MEK / MEK
S1085-WB6
24155971
Growth inhibition assay Cell viability IC50
S1085-viability1
24155971

Klinische Studieninformationen (Clinical Trial Information)

(Daten von https://clinicaltrials.gov, aktualisiert am 2024-05-22)

NCT-Nummer Rekrutierung Erkrankungen Sponsor/Kooperationspartner Startdatum Phasen
NCT06406465 Not yet recruiting
Carcinoma Neuroendocrine|Tumor Neuroendocrine|Tumors Neuroendocrine|Neuroendocrine; Carcinoma|Small Cell; Receptors
National Cancer Institute (NCI)|National Institutes of Health Clinical Center (CC)
 May 15 2024 Phase 2
NCT04315233 Recruiting
Metastatic Breast Cancer|Recurrent Ovarian Carcinoma
University of Utah|Novartis|Acrotech Biopharma
 May 3 2021 Phase 1
NCT04703920 Recruiting
Metastatic Breast Cancer|Metastatic Castration-resistant Prostate Cancer|Metastatic Ovarian Carcinoma
University of Michigan Rogel Cancer Center|Pfizer|Acrotech Biopharma Inc.
 March 4 2021 Phase 1
NCT03772925 Active not recruiting
Recurrent Acute Myeloid Leukemia|Recurrent Myelodysplastic Syndrome|Refractory Acute Myeloid Leukemia|Refractory Myelodysplastic Syndrome
National Cancer Institute (NCI)
 June 20 2019 Phase 1

Häufig gestellte Fragen (Frequently Asked Questions)

Frage 1:
Could you please give some suggestions for the use of it in vivo (i.p. injection)?

Antwort:
For I.P. injection, it can be dissolved in 2% DMSO+30% PEG 300+ddH2O at 10 mg/ml clearly. When preparing the solution, please dissolve this compound in DMSO clearly first. Then add PEG, after they mixed well, then dilute with water. Hope this information is useful to you.