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Chaetocin Histone Methyltransferase Inhibitor

Kat.-Nr.S8068

Chaetocin, ein Naturprodukt aus Chaetomium-Arten, ist ein Histon-Methyltransferase-Inhibitor mit IC50 von 0,8 μM, 2,5 μM und 3 μM für dSU(VAR)3-9, Maus-G9a bzw. Neurospora crassa DIM5. Chaetocin ist ein Antikrebsmittel und Inhibitor der Thioredoxin-Reduktase (TrxR).
Chaetocin Histone Methyltransferase Inhibitor Chemical Structure

Chemische Struktur

Molekulargewicht: 696.84

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Qualitätskontrolle

Charge: Reinheit: 99.82%
99.82

Zellkultur, Behandlung & Arbeitskonzentration

Zelllinien Assay-Typ Konzentration Inkubationszeit Formulierung Aktivitätsbeschreibung PMID
A549 Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human A549 cells, IC50 = 0.025 μM. 20303767
Hep3b Function assay Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF expression in human Hep3b cells by luciferase reporter gene assay, IC50 = 0.04 μM. 22305612
Hep3b Function assay Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF secretion in human Hep3b cells by ELISA, IC50 = 0.1 μM. 22305612
Jurkat Cytotoxicity assay 40 hrs Cytotoxicity against human Jurkat cells after 40 hrs bioluminescence assay, IC50 = 0.6 μM. 20303767
Drosophila melanogaster SL2 Function assay 0.1 uM 5 days Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.1 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density 16408017
Drosophila melanogaster SL2 Function assay 0.5 uM 5 days Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.5 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density 16408017
Drosophila melanogaster SL2 Function assay 0.5 uM Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me3 at 0.5 uM by immunostaining method 16408017
HL60 Apoptosis assay 30 uM 4 hrs Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as necrotic cell death at 30 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis 20675131
HL60 Apoptosis assay 0.3 uM 4 hrs Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as nuclear fragmentation at 0.3 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis 20675131
HL60 Apoptosis assay 0.3 uM 2 hrs Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as activation of caspase 3 at 0.3 uM after 2 hrs by Western blot analysis 20675131
MCF7 Function assay Inhibition of histone-lysine N-methyltransferase in human MCF7 cells assessed as decrease in methylation of RARbeta DNA by qPCR method ChEMBL
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Chemische Informationen, Lagerung & Stabilität

Molekulargewicht 696.84 Formel

C30H28N6O6S4

Lagerung (Ab dem Eingangsdatum)
CAS-Nr. 28097-03-2 SDF herunterladen Lagerung von Stammlösungen

Löslichkeit

In vitro
Charge:

DMSO : 25 mg/mL (35.87 mM)
(Feuchtigkeitskontaminiertes DMSO kann die Löslichkeit verringern. Verwenden Sie frisches, wasserfreies DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molaritätsrechner

Masse Konzentration Volumen Molekulargewicht
Verdünnungsrechner Molekulargewichtsrechner

In vivo
Charge:

In-vivo-Formulierungsrechner (Klare Lösung)

Schritt 1: Geben Sie die untenstehenden Informationen ein (Empfohlen: Ein zusätzliches Tier zur Berücksichtigung von Verlusten während des Experiments)

mg/kg g μL

Schritt 2: Geben Sie die In-vivo-Formulierung ein (Dies ist nur der Rechner, keine Formulierung. Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn es im Abschnitt "Löslichkeit" keine In-vivo-Formulierung gibt.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berechnungsergebnisse:

Arbeitskonzentration: mg/ml;

Methode zur Herstellung der DMSO-Stammlösung: mg Wirkstoff vorgelöst in μL DMSO ( Konzentration der Stammlösung mg/mL, Bitte kontaktieren Sie uns zuerst, wenn die Konzentration die DMSO-Löslichkeit der Wirkstoffcharge überschreitet. )

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügenμL PEG300, mischen und klären, dann hinzufügenμL Tween 80, mischen und klären, dann hinzufügen μL ddH2O, mischen und klären.

Methode zur Herstellung der In-vivo-Formulierung: Nehmen Sie μL DMSO Stammlösung, dann hinzufügen μL Maisöl, mischen und klären.

Hinweis: 1. Bitte stellen Sie sicher, dass die Flüssigkeit klar ist, bevor Sie das nächste Lösungsmittel hinzufügen.
2. Achten Sie darauf, das/die Lösungsmittel der Reihe nach hinzuzufügen. Sie müssen sicherstellen, dass die bei der vorherigen Zugabe erhaltene Lösung eine klare Lösung ist, bevor Sie mit der Zugabe des nächsten Lösungsmittels fortfahren. Physikalische Methoden wie Vortex, Ultraschall oder ein heißes Wasserbad können zur Unterstützung des Lösens verwendet werden.

Wirkmechanismus

Targets/IC50/Ki
dSU(VAR)3-9
0.8 μM
mouse G9a
2.5 μM
Neurospora crassa DIM5
3 μM
In vitro

In SL-2 Drosophila-Gewebekulturzellen bewirkt Chaetocin die Hemmung von SU(VAR)3-9 und der Anzahl der an Lys9 dimethylierten H3-Moleküle und hemmt auch das Zellwachstum.

In menschlichen HepG2-, Hep3B- und Huh7-Hepatomzellen hemmt diese Verbindung HIF-1-vermittelte hypoxische Reaktionen.

Es hemmt auch potent die Proliferation und Koloniebildung in einer Vielzahl von Krebszelllinien mit IC50 von 2-10 nM.

Kinase-Assay
Methylierungsassays
Sofern nicht anders angegeben, werden die Reaktionen wie folgt durchgeführt: 1 g gereinigtes Enzym (dSU(VAR)3-9 213; GST-hSUV39H1(82-412); GST-ncDIM5(19-318) und GSTmG9a(621-1000); dPRSET7(1-691); His-SET7/9(109-366) oder im Baculovirus-Expressionssystem exprimierter Enzymkomplex (dE(z), dSU(Z)12, dp55, dESC)) wurden 30 Minuten lang mit 1 g eines Peptids, das die ersten 19 Aminosäuren von H3 plus einen zusätzlichen Cysteinrest (ARTKQTARKSTGGKAPRKQC) enthält, in einem Gesamtvolumen von 40 μl in BC25 (10 mM HEPES pH 7,6, 25 mM NaCl, 1 mM EDTA, 10 % Glycerin) inkubiert. Alle Enzyme außer dem E(z)-Komplex hatten eine ähnliche spezifische Aktivität zwischen 5-10 nmol/min/mg. Für den E(z)-Komplex ist die spezifische Aktivität etwa 5-10-mal niedriger, was wahrscheinlich auf eine unvollständige Bildung des vollständigen Komplexes zurückzuführen ist, der für die höchste Aktivität erforderlich ist. Als Methyldonor ist S-Adenosyl[methyl-3H]methionin (SAM) in der Reaktion in einer Endkonzentration von 40 M mit einer spezifischen Aktivität von 0,3 Ci/mmol vorhanden. Die Reaktionen werden durch Zugabe von 1/10 Volumen 100%iger Essigsäure gestoppt und der Einbau von Radioaktivität wird durch Auftragen von 30 μl der Reaktion auf P81-Filterpapier und anschließendes Szintillationszählen gemessen. Für das Inhibitorscreening werden 1 μl dieser Verbindung mit einer Konzentration von 10 g/l zu jeder Reaktion gegeben. In den Fällen, in denen PRSET7 oder der E(z)-Komplex als Enzym verwendet wird, ersetzten rekombinante Nukleosomen (1 g) bzw. rekombinantes H3 (1 g) das H3-Peptid als Substrat.
In vivo

Bei Hepa 1c1c-7-Tumor tragenden Mäusen hemmt Chaetocin (0,25 mg/kg, i.p.) das Tumorwachstum durch Deregulierung der HIF-1[alpha]-vermittelten Angiogenese.

Bei SKOV3-Tumor tragenden Nacktmäusen verzögert diese Verbindung (0,25 mg/kg, i.p.) das Tumorwachstum signifikant mit minimalen Anzeichen von Toxizität.

Literatur
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36070144/

Anwendungen

Methoden Biomarker Bilder PMID
Western blot Procaspase-3 / Cleaved Caspase-3 / PARP
S8068-WB1
26890137
Growth inhibition assay Cell viability
S8068-viability1
18176557

Technischer Support

Handhabungshinweise

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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